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PZCT

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何去查找具有已知一段序列的的蛋白 已有3人参与

根据需要,已经合成了一段多肽,但是想去查找下具有这样一段相同序列或相似序列的肽段蛋白质有哪些?怎么查呢,用数据库怎么查呢?求帮助。
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by PZCT at 2015-03-26 13:07:01
我也查过,不知具体如何使用,我是新手,请详细说下,万分感谢!...

打开Uniport ,网址:http://www.uniprot.org/,点击Blast,然后输入序列,点击run blast ,就出现结果了,你看一下,我截图了
如何去查找具有已知一段序列的的蛋白
1.png


如何去查找具有已知一段序列的的蛋白-1
UniProt.png

todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
4楼2015-03-27 08:38:45
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
Uniport上面可以查到的
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
2楼2015-03-26 13:03:32
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PZCT

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 18761615793 at 2015-03-26 13:03:32
Uniport上面可以查到的

我也查过,不知具体如何使用,我是新手,请详细说下,万分感谢!
3楼2015-03-26 13:07:01
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI或 uniprot上blast一下就可以。。把序列复制粘贴上去,然后选择blastp。。也可以根据需要只显示植物或者人类的结果。。
5楼2015-03-27 17:33:16
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