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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

[求助] 如何找到一个基因前面后面的一片基因? 已有1人参与

在一个已知基因组的菌株中,已知一个特定基因,怎样找到其前后的一片基因?
如下图所示,已知caiT,怎么样找到它周围的各个酶、调控因子和未知基因?
之前很少接触生物信息学,麻烦大侠解释的详细一些,具体用了什么软件、步骤是怎么样的。

如何找到一个基因前面后面的一片基因?
截图01.jpg
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小毛孩24: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢! 2015-03-20 09:10:42
要是基因组序列在NCBI公布了,就可以到NCBI的mapview查看
2楼2015-03-20 09:06:51
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-03-20 09:06:51
要是基因组序列在NCBI公布了,就可以到NCBI的mapview查看

请问mapview在哪里。。。
能否劳烦举个例子说明一下?
3楼2015-03-20 09:52:35
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小毛孩24(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励热心回帖交流 2015-03-22 15:51:07
小毛孩24: 金币+10, 谢谢! 2015-05-12 20:46:05
以人类APOA5基因为例说明。
在NCBI的其他地方,可以找到APOA5基因是在11号染色体的。这个很容易,就不多说了。
首先进入NCBI的mapview页面http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/,找到你想看的物种。物种名字的右边有一个放大镜形状标记,点击进去就可以看到所有染色体。
在页面上班search for那里输入要找的基因“APOA5”,on chromosome后面输入“11”,然后点击find,会看到下面染色体总图中11号染色体有红色标记,点击染色体号“11”那个位置,就可以转到基因页面了。这个页面的左边中间部分,有两串数字,那里是显示的范围,可以调整数字来看染色体不同的位置。
4楼2015-03-20 17:16:43
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