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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何找到一个基因前面后面的一片基因？
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

[求助] 如何找到一个基因前面后面的一片基因？ 已有1人参与

在一个已知基因组的菌株中，已知一个特定基因，怎样找到其前后的一片基因？
如下图所示，已知caiT，怎么样找到它周围的各个酶、调控因子和未知基因？
之前很少接触生物信息学，麻烦大侠解释的详细一些，具体用了什么软件、步骤是怎么样的。

如何找到一个基因前面后面的一片基因？
截图01.jpg
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1楼 2015-03-20 08:56:08
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小毛孩24: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2015-03-20 09:10:42
要是基因组序列在NCBI公布了，就可以到NCBI的mapview查看
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2楼2015-03-20 09:06:51
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-03-20 09:06:51
要是基因组序列在NCBI公布了，就可以到NCBI的mapview查看

请问mapview在哪里。。。
能否劳烦举个例子说明一下？
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-20 09:52:35
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小毛孩24(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励热心回帖交流 2015-03-22 15:51:07
小毛孩24: 金币+10, 谢谢！ 2015-05-12 20:46:05
以人类APOA5基因为例说明。
在NCBI的其他地方，可以找到APOA5基因是在11号染色体的。这个很容易，就不多说了。
首先进入NCBI的mapview页面http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/，找到你想看的物种。物种名字的右边有一个放大镜形状标记，点击进去就可以看到所有染色体。
在页面上班search for那里输入要找的基因“APOA5”，on chromosome后面输入“11”，然后点击find，会看到下面染色体总图中11号染色体有红色标记，点击染色体号“11”那个位置，就可以转到基因页面了。这个页面的左边中间部分，有两串数字，那里是显示的范围，可以调整数字来看染色体不同的位置。
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4楼2015-03-20 17:16:43
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