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DS分子动力学时间设置问题
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LinuxHawk
新虫
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(幼儿园)
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虫号: 2536895
注册: 2013-07-08
专业: 生物信息学
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]
DS分子动力学时间设置问题
已有1人参与
用DS做分子动力学模拟,比如需要进行1000ps的分子动力学计算,模拟步长为1ps,每隔100fs收集一份子构象怎么设置。
按图中的设置吗?
新手不懂求大牛指导。
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2015-03-16 14:32:57
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玄泷sunny
金虫
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在线: 103.5小时
虫号: 2927425
注册: 2014-01-12
性别: GG
专业: 化学生物学与生物有机化学
你好,我也是DS新手,可以留下联系方式,一起学习吗
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努力
3楼
2015-04-20 09:08:55
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monsoncupid
金虫
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虫号: 2637881
注册: 2013-09-05
专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
time step只能设0.001(1fs)或者0.002(2fs),如果设置成0.002还要设置另外一个氢键震动限制。然后相应的调整save frequency=100或者50
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宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
4楼
2015-04-22 15:30:02
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2026-08-28
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ZPa0EcMwuECS
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考研
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售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
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ASdOkHsho7FD
2026-08-28
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ZPa0EcMwuECS
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国自然面上复盘~欢迎讨论
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2026-08-26
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symmetry
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麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上)
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Jacob678
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我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧?
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gouxfjh
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jklily
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为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难
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Kittylucky
2026-08-27
13/650
2026-08-29 00:04
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superceng
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怎么查啊
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huang1991js
2026-08-26
6/300
2026-08-28 08:42
by
winsaint
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哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识
+5
yuleib84
2026-08-26
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2026-08-28 00:02
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yudaoqian88
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怎么看青基中了没有啊
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叶九微
2026-08-26
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l_zh2008
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在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。
(金币+10)
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ziyangfang
2026-08-25
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2026-08-25 20:26
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huagongfeihu
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