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LinuxHawk

新虫 (初入文坛)

[求助] DS分子动力学时间设置问题 已有1人参与

用DS做分子动力学模拟,比如需要进行1000ps的分子动力学计算,模拟步长为1ps,每隔100fs收集一份子构象怎么设置。
DS分子动力学时间设置问题
按图中的设置吗?
新手不懂求大牛指导。
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玄泷sunny

金虫 (小有名气)

你好,我也是DS新手,可以留下联系方式,一起学习吗
努力
3楼2015-04-20 09:08:55
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

time step只能设0.001(1fs)或者0.002(2fs),如果设置成0.002还要设置另外一个氢键震动限制。然后相应的调整save frequency=100或者50
宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
4楼2015-04-22 15:30:02
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