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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 分子动力学问题求助
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intro987

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学问题求助

先问一个原理性的问题，分子动力学计算能得到什么结果？百度了一下没看太懂，求一个比较通俗点的说法
我想比较两个结构的稳定性（LTA分子筛，其中一个纯si的，另外一个构型中的一个Si被Al替换），老师让用分子动力学算一下，我想问一下，两个构型都用dmol3优化，通过geometry optimization得到的能量能否比较稳定性？用dml3的dynamic计算得到的结果应该如何比较，比较温度（目前正在用默认的设置计算，不过耗时很长，先上来问一下）？
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1楼 2013-12-30 16:45:22
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cosfrist

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-12-30 22:31:54
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-03 09:57:10
1 能否通过键合的角度来分析比较？
2 比较优化收敛情况，收敛速度快的是不是更稳定？
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力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
2楼2013-12-30 16:53:35
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intro987

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cosfrist at 2013-12-30 16:53:35
1 能否通过键合的角度来分析比较？
2 比较优化收敛情况，收敛速度快的是不是更稳定？

1.替换Al之后的成键角度？应该是变大稳定还是变小稳定啊？
2.应该有收敛标准吧，分子动力学得到的结果是能量，还是温度，还是别的数据啊？应该不是收敛快慢来比较吧？
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3楼2013-12-30 17:18:34
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cosfrist

木虫 (小有名气)
★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2014-01-03 09:57:51
引用回帖:
3楼: Originally posted by intro987 at 2013-12-30 17:18:34
1.替换Al之后的成键角度？应该是变大稳定还是变小稳定啊？
2.应该有收敛标准吧，分子动力学得到的结果是能量，还是温度，还是别的数据啊？应该不是收敛快慢来比较吧？...

1 比较下替换后其他的成建，一般变小更稳定。
2 可以试试体系总能。或者你这样考虑，你相当于在体系C中将A替换为B，那么，单独的A原子能量多少，B原子能量多少，分别放入体系后的CA和CB是多少，然后比较两个的差值 CA-A 和 CB-B，一般来说释放的能越大的话构成的体系越稳定？因为你需要更大的能去破坏？
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力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
4楼2013-12-31 10:46:30
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