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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 经典分子动力学截断半径设置为多少比较合适？
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] 经典分子动力学截断半径设置为多少比较合适？ 已有1人参与

在DL_POLY中，截断半径有两个：一个是总的截断半径cutoff，另外一个是范德华力截断半径rvdw cutoff. 程序要求rvdw cutoff <=cutoff.

我的问题是，根据什么原则来设置cutoff呢？

（1）如果计算资源无限，原则上，是不是cutoff越大越好？

（2）是不是可以通过一个系列的测试来确定合理的cutoff: 按照一定间隔设置5~8个截断半径，相同状态（nPVT)下,看系统平衡后的总能随截断半径的变化趋势。
截断半径越大，总能越低，取总能趋于稳定的最小截断半径。

（3）设置一套参数，计算可以与实验结果相比较的性质，一次来判定参数设置的合理性。但我觉得，应该先按照（2）的方式明确截断半径的影响规律，然后才考虑与实验结果的对比验证。因为，即使与实验吻合的再好，但对其中的物理本质和规律没有理解到，不能算是好的模拟计算工作。

(4)具体到简单气体分子（5个原子以下的气体分子）体系，近常温常压下分子之间的距离在15~30埃；如果考虑200*200*300埃的大盒子，截断半径一般在多大范围？
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amber

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1楼 2014-06-02 15:27:50
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
请问版主有DL_POLY classic的安装包吗？
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我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
2楼2014-06-02 15:37:42
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
内容已删除
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3楼2014-06-02 16:01:44
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cenwanglai: 金币+10, ★★★很有帮助, 感谢你的回复！ 2014-06-04 06:57:50
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-06-16 19:24:41
范德华力属于长程引力，Cutoff不宜设置太小。但是设置太大了明显大幅增加计算量，因此cutoff应该设置成满足计算精度的前提条件下的最小值。
如果势函数中已经规定了cutoff，那就不费心了。
如果势函数参数已经确定，而cutoff不确定，那么cutoff定为多少合适呢？ 一般来说应该做一个测试，设置不同的cutoff，如果有Rc1<Rc2，而相应的能量和力，以及结构参数RDF等的计算结果基本一样，那么就设为Rc1。
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4楼2014-06-03 09:29:31
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