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cenwanglai荣誉版主 (知名作家)
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经典分子动力学截断半径设置为多少比较合适？ 已有1人参与
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在DL_POLY中，截断半径有两个：一个是总的截断半径cutoff，另外一个是范德华力截断半径rvdw cutoff. 程序要求rvdw cutoff <=cutoff. 我的问题是，根据什么原则来设置cutoff呢？ （1）如果计算资源无限，原则上，是不是cutoff越大越好？ （2）是不是可以通过一个系列的测试来确定合理的cutoff: 按照一定间隔设置5~8个截断半径，相同状态（nPVT)下,看系统平衡后的总能随截断半径的变化趋势。 截断半径越大，总能越低，取总能趋于稳定的最小截断半径。 （3）设置一套参数，计算可以与实验结果相比较的性质，一次来判定参数设置的合理性。但我觉得，应该先按照（2）的方式明确截断半径的影响规律，然后才考虑与实验结果的对比验证。因为，即使与实验吻合的再好，但对其中的物理本质和规律没有理解到，不能算是好的模拟计算工作。 (4)具体到简单气体分子（5个原子以下的气体分子）体系，近常温常压下分子之间的距离在15~30埃；如果考虑200*200*300埃的大盒子，截断半径一般在多大范围？ |
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 amber |
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范德华力属于长程引力，Cutoff不宜设置太小。但是设置太大了明显大幅增加计算量，因此cutoff应该设置成满足计算精度的前提条件下的最小值。 如果势函数中已经规定了cutoff，那就不费心了。 如果势函数参数已经确定，而cutoff不确定，那么cutoff定为多少合适呢？ 一般来说应该做一个测试，设置不同的cutoff，如果有Rc1<Rc2，而相应的能量和力，以及结构参数RDF等的计算结果基本一样，那么就设为Rc1。 |
4楼2014-06-03 09:29:31
