24小时热门版块排行榜    

查看: 5094  |  回复: 9

雪雨星风17

木虫 (小有名气)

[求助] lammps 势能问题 已有1人参与

最近在计算MoS2的时候,遇到了势能选取的困难,参考一篇文献,《Phonon thermal conductivity of monolayer MoS2 sheet and nanoribbons》,里面的势能是混合的,我询问作者在lammps中如何使用该势能,作者答复是在lammps中以morse势能使用的,并且告诉我:”it is a Morse typed potential. In LAMMPS, the format of potential is different from its initial one, you need to change the expression and the corresponding parameters, such as people do for SW potential.“于是,我就看不懂了,morse势能在lammps中的调用类似于LJ势能,应该怎样类似于SW势能改呢?这个修改的势能到底如何在lammps中调用呢,这几篇参考文献在附件中,包括所需要的参数在参考文献28,29中,希望大神帮助啊。lammps 势能问题
}F}N)){KFD55TALOA5~Z2MC.png


lammps 势能问题-1
ZC)7D]NVESNYF)HS_XNK%IM.png


lammps 势能问题-2
A}9BR6BL)XKMQBVZ8TR7RM2.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

可以可以啊
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z654023015

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
雪雨星风17: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-01-08 15:39:11
LZ 为什么不用 MoS2 的SW势呢
2楼2015-01-06 20:31:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪雨星风17

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by z654023015 at 2015-01-06 20:31:00
LZ 为什么不用 MoS2 的SW势呢

那个MoS2的SW势能是指Jin-Wu Jiang的那篇Molecular dynamics simulations of single-layer molybdenum disulphide (MoS2)么?按照我的理解,这个文献说的SW势能好像只能模拟单层的MoS2之间的作用力,不知道我理解的对不对哈?
可以可以啊
3楼2015-01-06 21:54:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z654023015

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 雪雨星风17 at 2015-01-06 21:54:54
那个MoS2的SW势能是指Jin-Wu Jiang的那篇Molecular dynamics simulations of single-layer molybdenum disulphide (MoS2)么?按照我的理解,这个文献说的SW势能好像只能模拟单层的MoS2之间的作用力,不知道我理解 ...

是的,它是单层的,但是多层的也只是层与层之间再有一个范德瓦尔斯力。你如果要用这个SW算多层的话,只要添加一个lj势,作用的参数在MD simulations of molybdenum disulphide (MoS2): Force-field parameterization and thermal transport behavior 这篇文章里面有。
4楼2015-01-08 10:45:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪雨星风17

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by z654023015 at 2015-01-08 10:45:59
是的,它是单层的,但是多层的也只是层与层之间再有一个范德瓦尔斯力。你如果要用这个SW算多层的话,只要添加一个lj势,作用的参数在MD simulations of molybdenum disulphide (MoS2): Force-field parameterizati ...

哈,仔细看了下,描述两层直接确实用的是LJ势能,谢谢帮助啦
可以可以啊
5楼2015-01-08 15:38:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

WildDreams

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by z654023015 at 2015-01-08 10:45:59
是的,它是单层的,但是多层的也只是层与层之间再有一个范德瓦尔斯力。你如果要用这个SW算多层的话,只要添加一个lj势,作用的参数在MD simulations of molybdenum disulphide (MoS2): Force-field parameterizati ...

您好,想问下,在使用SW势的时候,data文件里是否应该给出化学键,键长,键角,二面角之类的信息。
另外Jin-Wu Jiang的那篇文章的supplementary material中的几个文件,是都需要编译到lmp_serial中去的吗?
mos2.sw
multirow.sty
natbib.sty
pair_sw.cpp
slashbox.sty
6楼2015-03-26 22:02:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪雨星风17

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by WildDreams at 2015-03-26 22:02:21
您好,想问下,在使用SW势的时候,data文件里是否应该给出化学键,键长,键角,二面角之类的信息。
另外Jin-Wu Jiang的那篇文章的supplementary material中的几个文件,是都需要编译到lmp_serial中去的吗?
mos2 ...

sw势能不需要化学键,键长什么的信息,除了sw势能,下面几个都需要重新编译的。
可以可以啊
7楼2015-03-27 09:29:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

WildDreams

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 雪雨星风17 at 2015-03-27 09:29:58
sw势能不需要化学键,键长什么的信息,除了sw势能,下面几个都需要重新编译的。...

也就是说data文件里只需要原子的位置信息?
8楼2015-03-27 10:13:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪雨星风17

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by WildDreams at 2015-03-27 10:13:04
也就是说data文件里只需要原子的位置信息?...

是的,按照lammps的data格式就行了
可以可以啊
9楼2015-03-28 09:32:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

栗子酱2333

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 雪雨星风17 at 2015-03-27 09:29:58
sw势能不需要化学键,键长什么的信息,除了sw势能,下面几个都需要重新编译的。...

请问是怎么编译进LAMMPS里的呢,我问工程师他告诉我缺少一个readme文件
啦啦啦啦啦
10楼2019-09-04 20:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 雪雨星风17 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +7 自由煎饼果子 2026-03-16 7/350 2026-03-22 22:40 by ACS Nano——
[考研] 306求调剂 +6 chuanzhu川烛 2026-03-18 6/300 2026-03-22 19:39 by 公瑾逍遥
[考研] 一志愿华中农业071010,总分320求调剂 +5 困困困困坤坤 2026-03-20 6/300 2026-03-22 17:41 by hxsm
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +5 shxchem 2026-03-20 7/350 2026-03-21 17:09 by ColorlessPI
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +12 墨墨漠 2026-03-18 13/650 2026-03-21 01:42 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 求调剂 +3 暗涌afhb 2026-03-16 3/150 2026-03-20 00:28 by 河南大学校友
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
信息提示
请填处理意见