| 查看: 3028 | 回复: 4 | |||
chenai.com木虫 (正式写手)
|
[交流]
lammps中固定键长 已有1人参与
|
| 本人目前使用LAMMPS遇到一个问题，想固定键长。用fix shake的话，提示要给出bond_style和bond_coeff，但文章中没有给出键伸缩的势参数，我用bond_style none，依旧无法实现，最后我随便给了一个bond_style和bond_coeff，可以运算，但我不知道这样做是否合理了。然后我又查了相关文献，有文献直接将分子设为刚体的，即rigid，于是我成角作用也不考虑，直接把分子设为刚体。用fix rigid/nvt可以运算了，结果也还可以，但只有fix rigid，fix rigid/nvt和fix rigid/nve，我想做npt，无法实现，想想设为rigid之后确实再npt从原理上就是不合理的。然后看了下fix freeze，更是不行。望有人指点，我要做npt，然后体系的话SO2考虑成角不考虑成键，后者两者都不考虑，如何来实现，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有8人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
申请删除本帖
已经有7人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有6人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 各位高手，怎么在windows下编译LAMMPS？
已经有4人回复
- 在Lammps中安装xmovie工具时，Makefile文件怎么修改X库路径
已经有3人回复
- 如何固定键长进行优化
已经有3人回复
- 用dfix固定溶剂O-H键长，精修后的键长值不对丫。。。
已经有5人回复
- 薄膜在lammps条件下的谐振
已经有5人回复
- 【求助】键长键角等固定后的优化..悬赏30...【已经解决～感谢～】
已经有22人回复
- 【讨论】lammps中利用velocity命令无法控制住速度问题
已经有11人回复
- 【讨论】lammps中关于fix ave/spatial命令的输出问题
已经有4人回复
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格创建问题
已经有14人回复
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
2楼2011-05-13 19:14:04
chenai.com
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1601
- 帖子: 457
- 在线: 214.3小时
- 虫号: 1072399
- 注册: 2010-08-10
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
3楼2011-05-13 22:14:41
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
4楼2011-05-16 09:17:21
chenai.com
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1601
- 帖子: 457
- 在线: 214.3小时
- 虫号: 1072399
- 注册: 2010-08-10
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
5楼2011-05-17 09:12:39
投票:
10