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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 怎么得到分子动力学模拟的RMSD啊？最近急用、
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hc8850

金虫 (初入文坛)

[求助] 怎么得到分子动力学模拟的RMSD啊？最近急用、 已有2人参与

怎么得到分子动力学模拟的RMSD啊？最近急用、我的模拟能量也优化了，但是得到的RMSD只是一张空白的图，请问有什么方法啊？
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1楼 2015-01-05 16:00:58
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hc8850

金虫 (初入文坛)
真是谢谢。
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2楼2015-01-05 22:05:55
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abinitio

版主 (著名写手)
用什么软件？
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3楼2015-01-06 07:51:24
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hc8850

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2015-01-06 07:51:24
用什么软件？

gromacs
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4楼2015-01-06 11:08:12
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
hc8850(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导 2015-01-09 10:36:21
没用过gromacs，可能需要自己写程序了。平均的平方减平方的平均，再开方
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5楼2015-01-06 17:34:44
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shengxiang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
hc8850(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导 2015-01-09 10:36:29
你是用g_rmsd得到的数据吗？正常来讲应该是很容易得到的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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6楼2015-01-07 07:39:26
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hc8850

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by shengxiang at 2015-01-07 07:39:26
你是用g_rmsd得到的数据吗？正常来讲应该是很容易得到的

对啊，我就是用的这个语句，但是得到的RMSD却是一张空白。
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7楼2015-01-07 13:01:54
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