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Ct法实时荧光定量 PCR分析标准菌株和样品的循环数,怎么控制二者浓度在同一水平?
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刚开始接触real-time pcr,参考奶粉中阪崎肠杆菌荧光定量PCR检测行业标准SN/T 1632.3-2005,准备开发益生菌动物双歧杆菌乳亚种BB12的鉴定方法,主要思路如下: 采用动物双歧杆菌乳亚种标准菌株(ATCC 27536)作为标准品,以添加BB12配方奶粉为样品,分别提取DNA,通过荧光定量PCR测定对应循环数Ct值,比较标准品与样品Ct值,结合微生物生化鉴定结果,实现双歧杆菌亚种的鉴定,参考一篇英文文献,样品与标菌的CT值基本吻合,且CT值≤27,报告检出BB12。 请给位大神指导一下,需不需要调节标菌和样品的浓度一致?是要调控菌悬液中菌落数一致,还是cDNA或者其他?具体怎么操作呢? 根据文献内容,选了一个内参基因RPL32,可是在Genbank中没找到对应的基因序列,在EMBL和DDBJ数据库中也未找到,求大神指导~~~PS:可否用内参基因来校准样品与标品的浓度差呢? |
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