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孤鸿飘渺影

新虫 (小有名气)

[求助] 求助!小载体连大片段怎么连,求高手指点!

我一个4.2k的载体连接一个7k的片段,试了好几把都没连上。酶切位点是BspEⅠ和HindⅢ两个酶切位点。请各位高手支点招!多谢!
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邱玉信

禁虫 (小有名气)

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2楼2014-12-16 01:26:04
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gangouyang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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调整 载体VS 插入片段 的比列,可以尝试把载体当插入片段,把插入片段当载体,连接时间加长,建议用NEB的连接酶,效率高一些。
3楼2014-12-16 14:29:14
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孤鸿飘渺影

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gangouyang at 2014-12-16 14:29:14
调整 载体VS 插入片段 的比列,可以尝试把载体当插入片段,把插入片段当载体,连接时间加长,建议用NEB的连接酶,效率高一些。

我试过把载体当插入片段,只不过载体上有筛选基因,连接转化后,皿上长满克隆,挑了七八十个,没有一个是阳性。
4楼2014-12-16 14:48:19
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gangouyang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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孤鸿飘渺影: 金币+60, ★★★很有帮助, 多谢您的建议,我已经连上了。是将7k的片段分两部分连上的。 2015-01-29 15:20:07
听你说的,初步判断你的情况是:载体没切干净,载体自连。顺便说一句:挑6个clone鉴定,如果没有阳性的话,就重来再切一次载体,最多挑10个。另外,你赏的10金币有点少,如果按照以下分析问题得以解决的话,至少20金币。
解决方案:
1.首先确定你的酶切位点所用的两个酶在载体上是不是靠得太近了,甚至有共用碱基的情况,如果是,请换酶切位点,因为你不可能拿到双切的空载体。如果你非要用这两个酶,办法也是有的,就不赘述了。
2.如果不是1这种情况,那么建议你重新切载体,先用HindIII切,胶回收后,再用BspEⅠ切,再胶回收,请勿做同时双酶切,因为HindIII在buffer2中活性是100%,在其他的buffer中活性不高,BspEⅠ在buffer3活性中是100%,在其他的buffer中活性不高。
3.按照以下说明操作:把载体当插入片段,把插入片段当载体,连接时间加长,建议用NEB的连接酶,效率高一些。
祝你赏我金币,谢谢!
5楼2014-12-17 18:16:29
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孤鸿飘渺影

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gangouyang at 2014-12-17 18:16:29
听你说的,初步判断你的情况是:载体没切干净,载体自连。顺便说一句:挑6个clone鉴定,如果没有阳性的话,就重来再切一次载体,最多挑10个。另外,你赏的10金币有点少,如果按照以下分析问题得以解决的话,至少20金 ...

多谢指点,事成后奉上60金币。顺便问一句,你们做酶切,体系是怎么样的,一般切多少小时。
6楼2014-12-19 18:16:29
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