| 查看: 14292 | 回复: 14 | |||
[交流]
【求助/交流】请求高手指点，帮忙解释下TMHMM预测结果
|
|||
|
[img]我在TMHMM上分析了一下膜蛋白结构，但是不清楚结果中outside和inside是什么意思，如果是质膜上的蛋白outside和inside分别指哪，如果是液泡膜上的蛋白又分别指哪 一下是分析结果 # Sequence Length: 546 # Sequence Number of predicted TMHs: 12 # Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005 # Sequence Exp number, first 60 AAs: 33.35831 # Sequence Total prob of N-in: 0.50079 # Sequence POSSIBLE N-term signal sequence Sequence TMHMM2.0 outside 1 19 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 20 42 Sequence TMHMM2.0 inside 43 50 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 51 68 Sequence TMHMM2.0 outside 69 82 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 83 100 Sequence TMHMM2.0 inside 101 111 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 112 134 Sequence TMHMM2.0 outside 135 148 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 149 168 Sequence TMHMM2.0 inside 169 174 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 175 197 Sequence TMHMM2.0 outside 198 216 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 217 239 Sequence TMHMM2.0 inside 240 265 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 266 288 Sequence TMHMM2.0 outside 289 302 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 303 320 Sequence TMHMM2.0 inside 321 340 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 341 363 Sequence TMHMM2.0 outside 364 382 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 383 402 Sequence TMHMM2.0 inside 403 414 Sequence TMHMM2.0 TMhelix 415 437 Sequence TMHMM2.0 outside 438 546  |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有62人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请高人帮忙解释一下
已经有7人回复
- 求高手指教下文如何翻译
已经有4人回复
- 求大师指点（焦急等待指点）
已经有5人回复
- 求助一个witti-horner反应，做了好久没有做出来，请高手帮忙指点
已经有15人回复
- 分泌蛋白TMHMM预测求助！拜托各位虫子了！
已经有4人回复
- 求大师帮忙翻译
已经有1人回复
- 膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊
已经有5人回复
- 求助 TD_SCDMA tm代码
已经有4人回复
- 高手看看，那个碱性更强，求解释
已经有8人回复
- GS+软件的结果解释
已经有6人回复
- 帮忙解释解释这个构造形成的过程
已经有7人回复
- 谁能帮我解释一下C+(NH2)3的分子结构是什么
已经有6人回复
- 帮忙指点我的评价意见，不知道上会了没有？
已经有5人回复
- 链路预测问题求助
已经有3人回复
- 给老师发邮件，老师这么回复是什么意思，请大家帮忙解释下
已经有11人回复
- CSC结果公布时间预测
已经有35人回复
- Q_PCR结果，请高手指点一下
已经有13人回复
- 请求高手指点该反应怎么控制条件！
已经有7人回复
- 求高手指点:动态光散射（DLS） 的三个结果哪个更具有代表性
已经有33人回复
- 初学者请各位高手帮忙看一下GSAS精修的结果，请指点
已经有14人回复
- 【求助】求教高手帮忙解释这个奇怪的现象（关于色谱柱）
已经有9人回复
- 【请教】有谁用过石墨模具，请求指点
已经有20人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
广东石油化工学院，材料与化工、能源动力专硕，招收调剂生
+1/93
-
招化学相关专业硕士调剂生
+1/89
-
聊城大学省重点实验室 收化学专业硕士调剂、网上面试无笔试、名额充足、可调专业广泛
+1/82
-
湖北汽车工业学院汽车材料学院2026年接收调剂研究生（新能源电池方向）
+2/54
-
天津科大轻工学院国家级人才团队招收化学、材料、食品调剂
+1/38
-
2026-大连大学～六盘水师范学院联合培养硕士研究生，招收化学、环境等相关专业
+1/38
-
湖北师范大学化学化工学院招收调剂
+1/36
-
河南工业大学化学化工学院 2026 年硕士调剂正在进行！
+1/34
-
山东理工大学资源与环境工程学院招收调剂考生
+1/23
-
华南师范大学大分子体系多尺度模拟与实验研究团队招收2026年考研调剂生
+1/20
-
美国田纳西理工 | 人工智能/机器人/自动驾驶方向（全奖）
+1/16
-
中国石油大学（北京）理学院2026年硕士研究生接收调剂生：物理、化学、材料等
+1/12
-
中国地震局地质研究所+地球物理/数学+接收调剂
+1/9
-
广西师范大学分子探针小组招有机化学、生物与医药专业硕士生2-3名
+1/9
-
【博士招生】天津理工大学国家杰青王铁课题组招收2026年博士研究生
+1/8
-
全国重点实验室调剂
+1/5
-
大连工业大学考研调剂
+1/3
-
台州学院接收化学、化工与材料方向调剂
+1/3
-
苏州科技大学胡老师课题组招2026年硕士生若干名
+1/2
-
齐齐哈尔大学栗洪彬老师招收2026年纺织工程调剂研究生(学术型硕士2名，专业硕士1名）
+1/2
13楼2014-01-14 16:13:52
12楼2011-06-15 14:30:00
2楼2011-03-14 20:51:07
3楼2011-03-14 22:19:34
4楼2011-03-15 10:01:11
5楼2011-03-15 16:45:15
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+4): Good！ 2011-06-12 08:57:29
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+4): Good！ 2011-06-12 08:57:29
|
质膜上的蛋白outside和inside分别指的是细胞膜外和细胞膜内，我不明白的是# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005 # Sequence Exp number, first 60 AAs: 33.35831表示什么意思，还有# Sequence Total prob of N-in: 0.50079 是表示N端在细胞膜内的可能性为0.50079吗？ 咋没人讨论这个呢，请高手指点 |
6楼2011-06-11 21:26:34
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
|
好吧，我的英语不好，直接给原文吧： Length: the length of the protein sequence. Number of predicted TMHs: The number of predicted transmembrane helices. Exp number of AAs in TMHs: The expected number of amino acids intransmembrane helices. If this number is larger than 18 it is very likely to be a transmembrane protein (OR have a signal peptide). Exp number, first 60 AAs: The expected number of amino acids in transmembrane helices in the first 60 amino acids of the protein. If this number more than a few, you should be warned that a predicted transmembrane helix in the N-term could be a signal peptide. Total prob of N-in: The total probability that the N-term is on the cytoplasmic side of the membrane. POSSIBLE N-term signal sequence: a warning that is produced when "Exp number, first 60 AAs" is larger than 10. ___________________这个估计是不看帮助，守株待兔，高手一看，回答吧，现成答案在那~~~~~~~~~~~~~~~所以就走了，还是呼吁大家有些东西，能找到标准的，还是看原版，毕竟硕士阶段也得学会文献检索吧，提问尽量是一些实际操作中，教科书找不到现成答案的技术性问题，或者一些思考。 |
8楼2011-06-13 02:16:08
9楼2011-06-13 08:51:02
10楼2011-06-13 08:59:11
11楼2011-06-13 11:15:13
14楼2014-01-14 16:14:54
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
15楼2018-08-14 09:32:30
简单回复
西瓜7楼
2011-06-12 08:57
回复
