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dandan_hui

木虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 5084.8
帖子: 346
在线: 16.1小时
虫号: 647551

[交流] 【求助/交流】请求高手指点，帮忙解释下TMHMM预测结果

[img]我在TMHMM上分析了一下膜蛋白结构，但是不清楚结果中outside和inside是什么意思，如果是质膜上的蛋白outside和inside分别指哪，如果是液泡膜上的蛋白又分别指哪
一下是分析结果
# Sequence Length: 546
# Sequence Number of predicted TMHs:  12
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  33.35831
# Sequence Total prob of N-in:       0.50079
# Sequence POSSIBLE N-term signal sequence
Sequence TMHMM2.0 outside       1 19
Sequence TMHMM2.0 TMhelix       20 42
Sequence TMHMM2.0 inside       43 50
Sequence TMHMM2.0 TMhelix       51 68
Sequence TMHMM2.0 outside       69 82
Sequence TMHMM2.0 TMhelix       83 100
Sequence TMHMM2.0 inside    101 111
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    112 134
Sequence TMHMM2.0 outside    135 148
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    149 168
Sequence TMHMM2.0 inside    169 174
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    175 197
Sequence TMHMM2.0 outside    198 216
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    217 239
Sequence TMHMM2.0 inside    240 265
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    266 288
Sequence TMHMM2.0 outside    289 302
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    303 320
Sequence TMHMM2.0 inside    321 340
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    341 363
Sequence TMHMM2.0 outside    364 382
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    383 402
Sequence TMHMM2.0 inside    403 414
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    415 437
Sequence TMHMM2.0 outside    438 546

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1楼 2011-03-14 15:01:30

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

丫头7976

铜虫 (正式写手)

应助: 8 (幼儿园)
金币: 94.8
帖子: 799
在线: 216.6小时
虫号: 765213

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+4): Good！ 2011-06-12 08:57:29

质膜上的蛋白outside和inside分别指的是细胞膜外和细胞膜内，我不明白的是# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005
# Sequence Exp number, first 60 AAs: 33.35831表示什么意思，还有# Sequence Total prob of N-in: 0.50079 是表示N端在细胞膜内的可能性为0.50079吗？咋没人讨论这个呢，请高手指点