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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

[求助] 膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊 已有2人参与

膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊?
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wodehao110

新虫 (初入文坛)

本人刚刚读研,想请教楼主TMHMM是什么,怎么用啊,谢谢了
2楼2014-03-08 20:44:36
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woolley

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
预测有一定的准确度,而且主要根据氨基酸序列,如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的,也有可能预测不出来。
还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
可以是跨膜的beta桶
也可以是膜锚定,或者螺旋同膜的一侧有结合,这些个情况都是有可能的
3楼2014-03-10 11:40:35
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jenny6803

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
虽然我也不是很懂   但是最近也找过几个工具预测跨膜区的
你可以试试哈~毕竟是预测,不同工具算出来的也是不完全相同就是
http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
https://www.predictprotein.org/
4楼2014-03-10 16:51:30
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mike45

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by woolley at 2014-03-10 11:40:35
TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
预测有一定的准确度,而且主要根据氨基酸序列,如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的,也有可能预测不出来。
还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
可以是跨膜的beta桶 ...

如果是β桶用什么软件预测
5楼2014-10-31 14:29:13
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小呀么萝卜

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

6楼2018-08-10 09:03:43
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