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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊
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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

[求助] 膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊 已有2人参与

膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊？
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1楼 2014-03-08 17:15:12
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wodehao110

新虫 (初入文坛)
本人刚刚读研，想请教楼主TMHMM是什么，怎么用啊，谢谢了
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2楼2014-03-08 20:44:36
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woolley

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
预测有一定的准确度，而且主要根据氨基酸序列，如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的，也有可能预测不出来。
还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
可以是跨膜的beta桶
也可以是膜锚定，或者螺旋同膜的一侧有结合，这些个情况都是有可能的
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3楼2014-03-10 11:40:35
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jenny6803

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
虽然我也不是很懂   但是最近也找过几个工具预测跨膜区的
你可以试试哈~毕竟是预测，不同工具算出来的也是不完全相同就是
http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
https://www.predictprotein.org/
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4楼2014-03-10 16:51:30
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mike45

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by woolley at 2014-03-10 11:40:35
TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
预测有一定的准确度，而且主要根据氨基酸序列，如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的，也有可能预测不出来。
还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
可以是跨膜的beta桶 ...

如果是β桶用什么软件预测
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5楼2014-10-31 14:29:13
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小呀么萝卜

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
6楼2018-08-10 09:03:43
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