24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dandan_hui

木虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 5084.8
帖子: 346
在线: 16.1小时
虫号: 647551

[交流] 【求助/交流】请求高手指点，帮忙解释下TMHMM预测结果

[img]我在TMHMM上分析了一下膜蛋白结构，但是不清楚结果中outside和inside是什么意思，如果是质膜上的蛋白outside和inside分别指哪，如果是液泡膜上的蛋白又分别指哪
一下是分析结果
# Sequence Length: 546
# Sequence Number of predicted TMHs:  12
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  33.35831
# Sequence Total prob of N-in:       0.50079
# Sequence POSSIBLE N-term signal sequence
Sequence TMHMM2.0 outside       1 19
Sequence TMHMM2.0 TMhelix       20 42
Sequence TMHMM2.0 inside       43 50
Sequence TMHMM2.0 TMhelix       51 68
Sequence TMHMM2.0 outside       69 82
Sequence TMHMM2.0 TMhelix       83 100
Sequence TMHMM2.0 inside    101 111
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    112 134
Sequence TMHMM2.0 outside    135 148
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    149 168
Sequence TMHMM2.0 inside    169 174
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    175 197
Sequence TMHMM2.0 outside    198 216
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    217 239
Sequence TMHMM2.0 inside    240 265
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    266 288
Sequence TMHMM2.0 outside    289 302
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    303 320
Sequence TMHMM2.0 inside    321 340
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    341 363
Sequence TMHMM2.0 outside    364 382
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    383 402
Sequence TMHMM2.0 inside    403 414
Sequence TMHMM2.0 TMhelix    415 437
Sequence TMHMM2.0 outside    438 546

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

请高人帮忙解释一下已经有7人回复
求高手指教下文如何翻译已经有4人回复
求大师指点（焦急等待指点）已经有5人回复
求助一个witti-horner反应，做了好久没有做出来，请高手帮忙指点已经有15人回复
分泌蛋白TMHMM预测求助！拜托各位虫子了！已经有4人回复
求大师帮忙翻译已经有1人回复
膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊已经有5人回复
求助 TD_SCDMA tm代码已经有4人回复
高手看看，那个碱性更强，求解释已经有8人回复
GS+软件的结果解释已经有6人回复
帮忙解释解释这个构造形成的过程已经有7人回复
谁能帮我解释一下C+(NH2)3的分子结构是什么已经有6人回复
帮忙指点我的评价意见，不知道上会了没有？已经有5人回复
链路预测问题求助已经有3人回复
给老师发邮件，老师这么回复是什么意思，请大家帮忙解释下已经有11人回复
CSC结果公布时间预测已经有35人回复
Q_PCR结果，请高手指点一下已经有13人回复
请求高手指点该反应怎么控制条件！已经有7人回复
求高手指点:动态光散射（DLS）的三个结果哪个更具有代表性已经有33人回复
初学者请各位高手帮忙看一下GSAS精修的结果，请指点已经有14人回复
【求助】求教高手帮忙解释这个奇怪的现象（关于色谱柱）已经有9人回复
【请教】有谁用过石墨模具，请求指点已经有20人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-03-14 15:01:30

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

啮风

铜虫 (小有名气)

MolEPI: 5
应助: 1 (幼儿园)
金币: 328.2
帖子: 82
在线: 224.2小时
虫号: 1121345

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

Originally posted by 丫头7976 at 2011-06-11 21:26:34:
质膜上的蛋白outside和inside分别指的是细胞膜外和细胞膜内，我不明白的是# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005
# Sequence Exp number, first 60 AAs: 33.35831表示什么意思，还有# Sequence Tota ...

好吧，我的英语不好，直接给原文吧：
Length: the length of the protein sequence.
Number of predicted TMHs: The number of predicted transmembrane helices.
Exp number of AAs in TMHs: The expected number of amino acids intransmembrane helices. If this number is larger than 18 it is very likely to be a transmembrane protein (OR have a signal peptide).
Exp number, first 60 AAs: The expected number of amino acids in transmembrane helices in the first 60 amino acids of the protein. If this number more than a few, you should be warned that a predicted transmembrane helix in the N-term could be a signal peptide.
Total prob of N-in: The total probability that the N-term is on the cytoplasmic side of the membrane.
POSSIBLE N-term signal sequence: a warning that is produced when "Exp number, first 60 AAs" is larger than 10.
___________________这个估计是不看帮助，守株待兔，高手一看，回答吧，现成答案在那~~~~~~~~~~~~~~~所以就走了，还是呼吁大家有些东西，能找到标准的，还是看原版，毕竟硕士阶段也得学会文献检索吧，提问尽量是一些实际操作中，教科书找不到现成答案的技术性问题，或者一些思考。