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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请求高手指点，帮忙解释下TMHMM预测结果
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dandan_hui

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】请求高手指点，帮忙解释下TMHMM预测结果

[img]我在TMHMM上分析了一下膜蛋白结构，但是不清楚结果中outside和inside是什么意思，如果是质膜上的蛋白outside和inside分别指哪，如果是液泡膜上的蛋白又分别指哪
一下是分析结果
# Sequence Length: 546
# Sequence Number of predicted TMHs:  12
# Sequence Exp number of AAs in TMHs: 240.68005
# Sequence Exp number, first 60 AAs:  33.35831
# Sequence Total prob of N-in:        0.50079
# Sequence POSSIBLE N-term signal sequence
Sequence        TMHMM2.0        outside             1    19
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix            20    42
Sequence        TMHMM2.0        inside            43    50
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix            51    68
Sequence        TMHMM2.0        outside            69    82
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix            83   100
Sequence        TMHMM2.0        inside           101   111
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           112   134
Sequence        TMHMM2.0        outside           135   148
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           149   168
Sequence        TMHMM2.0        inside           169   174
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           175   197
Sequence        TMHMM2.0        outside           198   216
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           217   239
Sequence        TMHMM2.0        inside           240   265
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           266   288
Sequence        TMHMM2.0        outside           289   302
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           303   320
Sequence        TMHMM2.0        inside           321   340
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           341   363
Sequence        TMHMM2.0        outside           364   382
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           383   402
Sequence        TMHMM2.0        inside           403   414
Sequence        TMHMM2.0        TMhelix           415   437
Sequence        TMHMM2.0        outside           438   546
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1楼 2011-03-14 15:01:30
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cyz20050505

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
你关注多少个跨膜螺旋就行了呗，outside和inside是指这个蛋白的部分肽链是在膜外还是在膜内，如果细胞膜，肯定在细胞质内的叫inside，但如果是液泡膜的话，因为液泡本身在细胞质内，所以此时位于细胞质的肽链为outside而在液泡内的为inside。EPI发给我啊，我回答的很详细哈。
赞一下(2人) 回复此楼
12楼2011-06-15 14:30:00
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dandan_hui

木虫 (正式写手)
高手帮帮忙吧，着急啊
赞一下 回复此楼
2楼2011-03-14 20:51:07
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
学习一下，最近也要做这方面的了
赞一下 回复此楼
3楼2011-03-14 22:19:34
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dandan_hui

木虫 (正式写手)
为什么没人回答呢
赞一下 回复此楼
5楼2011-03-15 16:45:15
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