| 查看: 2394 | 回复: 4 | ||
fan728516414银虫 (小有名气)
|
[求助]
autodock使用时grid打开pdb文件打不开为什么，是不是软件安装有问题 已有1人参与
|
|
到这步用不了了，要保存成pdbqt格式。 点击Grid→Macromolecule→Open→lock.pdb打开大分子文件，如有对话框弹出点击OK即可，由于MGL Tools对某些金属离子的电荷无法自动加，故在此例中对话框会提示你MN离子为零价。保存好lock.pdbqt文件后在文件夹中打开lock.pdbqt，此时即以文档形式打开，里面包含了各原子的电荷信息。一般金属原子的电荷都在最后几排。 这不实现不了，lock.pdb文件打不开，而在Chimera中能打开。 |
回复此楼» 猜你喜欢
318求调剂
已经有8人回复
-
求调剂
已经有7人回复
-
0703化学
已经有13人回复
-
307分材料专业求调剂
已经有4人回复
-
0855求调剂材料
已经有8人回复
-
332求调剂
已经有9人回复
-
甲醇/二氯 1:15过柱子
已经有3人回复
-
272求调剂
已经有4人回复
-
一志愿西北农林畜牧专硕336分求调剂
已经有3人回复
-
求调剂
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- autodock无法打开
已经有6人回复
- autodock对接的氢键
已经有7人回复
- Autodock的dlg文件有没有好的分析软件，一个一个另存导入到Pymol太慢了
已经有3人回复
- AutoDock怎么分析大分子与小分子之间的结合能
已经有7人回复
- 请教关于AUTODOCK做虚i拟筛选的问题
已经有7人回复
- AutoDock安装问题
已经有5人回复
- autodock对接时蛋白的处理问题
已经有6人回复
- Autodock中受体的准备
已经有14人回复
- Autodock在Ubuntu下的安装问题
已经有7人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- autodock安装好后导入分子为什么不对（附图）
已经有18人回复
- AutoDock产生的结果dlg文件转化成pdb文件
已经有13人回复
- 【求助】autodock中PDB转pdbqt格式问题？
已经有9人回复
- 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢
已经有12人回复
- 【求助】Autodock运行时无法生成log文件？
已经有12人回复
- 【求助】关于Autodock中Grid中的问题
已经有9人回复
wbf3ng
金虫 (小有名气)
- 应助: 116 (高中生)
- 金币: 2086.3
- 红花: 8
- 帖子: 255
- 在线: 171.4小时
- 虫号: 3202097
- 注册: 2014-05-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2014-12-13 20:20:35
fan728516414
银虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 466.3
- 散金: 20
- 红花: 20
- 帖子: 221
- 在线: 53.3小时
- 虫号: 3101326
- 注册: 2014-03-30
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
3楼2014-12-13 21:29:09
4楼2014-12-14 20:26:37
fan728516414
银虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 466.3
- 散金: 20
- 红花: 20
- 帖子: 221
- 在线: 53.3小时
- 虫号: 3101326
- 注册: 2014-03-30
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
5楼2014-12-14 20:29:19
