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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 为什么用16S rDNA方法与微生物自动鉴定仪 鉴定结果不同？
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dingting0532

金虫 (正式写手)

[求助] 为什么用16S rDNA方法与微生物自动鉴定仪 鉴定结果不同？ 已有2人参与

用16S rDNA方法鉴定出是异常球菌属 而用微生物自动鉴定仪 是玫瑰色库克菌（可能性99%）？ 这两种菌相同吗？
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1楼 2014-12-03 10:48:40
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
PLFA还是BIOLOG？你的自动鉴定仪
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致良知
2楼2014-12-03 18:05:33
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dingting0532

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-12-03 18:05:33
PLFA还是BIOLOG？你的自动鉴定仪

用的VITEK2微生物自动鉴定仪
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3楼2014-12-03 18:54:23
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quiller2000

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dingting0532 at 2014-12-03 18:54:23
用的VITEK2微生物自动鉴定仪...

生化啊~
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致良知
4楼2014-12-03 20:40:01
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dingting0532

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-12-03 20:40:01
生化啊~...

？不太懂？
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5楼2014-12-03 21:32:57
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油炸花生米

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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dingting0532: 金币+5, ★有帮助 2014-12-04 09:56:09
VITEK 2 是利用生化反应的原理编辑鉴定卡，好多同属的细菌生化反应很相近，根本无法仅仅通过生化反应来鉴定，比如嗜水气单胞和豚鼠气单胞这两个菌基本上十次有九次是分不开的，而且VITEK2 会鉴定出一些很不靠谱的菌，比如玫瑰库克，少动鞘氨醇等等，所以肯定是要以16S为准啊。当然了，还得看你自己的具体情况，有些时候还是要比对一下两者的结果，因为PCR的过程也会有很多变数。
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6楼2014-12-03 21:46:08
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油炸花生米

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dingting0532: 金币+3, ★有帮助 2014-12-04 09:56:22
不知道是楼主笔误还是什么，如果用16S鉴定的话，一定会给你一个菌种的名称而不会给你菌属的名称，如果比对出来的序列是菌属，那么就证明你P的这段序列有问题
如果想知道这两个菌是否为一种菌，建议你去一个uniprot上查找结果
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7楼2014-12-03 21:50:51
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dingting0532: 金币+2, ★有帮助 2014-12-04 09:56:31
多种鉴定手段结合才行，16S，BIOLOG,PLFA,API一起来
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致良知
8楼2014-12-03 23:12:57
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