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386113562

金虫 (小有名气)

[求助] 求高手帮忙看看我做的进化树 已有4人参与

求高手帮忙看看我做的进化树  我那株菌前面的100是什么意思?是不是认定他俩是一样的?  还有 能不能具体分析一下这个进化树,我有点不太会看,

求高手帮忙看看我做的进化树
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
386113562(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-12-02 18:44:36
100有点类似于“置信度”。软件构建进化树的时候不是一次就建好的,而是构建了很多棵树,然后根据这些树给出一个带有统计意义的结果。100的意思有点类似于“软件构建了100棵树,其中有100棵在这个节点是包含两个物种的”,同理那个71类似于“100棵树里有71棵是包含这么多内容的”,这和做100次重复实验一个道理。
数值是100并不表示两个序列就完全相同,而表示他们相似性最高。
2楼2014-12-02 09:57:21
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386113562

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-02 09:57:21
100有点类似于“置信度”。软件构建进化树的时候不是一次就建好的,而是构建了很多棵树,然后根据这些树给出一个带有统计意义的结果。100的意思有点类似于“软件构建了100棵树,其中有100棵在这个节点是包含两个物种 ...

你感觉我做的这个文章里面可以用吗
3楼2014-12-02 11:55:27
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 386113562 at 2014-12-02 11:55:27
你感觉我做的这个文章里面可以用吗...

看你想说明什么问题吧,要是进化树能解释得清楚就行。不过如果你的重点是100那个分支,那就太单薄了,需要多补充一些数据。
4楼2014-12-02 13:41:27
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386113562

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-02 13:41:27
看你想说明什么问题吧,要是进化树能解释得清楚就行。不过如果你的重点是100那个分支,那就太单薄了,需要多补充一些数据。...

NCBI上比对的序列全下载下来了只有这一株和我的菌在通一个分支里面,我也感觉单薄,请问我该怎么办
5楼2014-12-02 14:48:28
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386113562

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-02 13:41:27
看你想说明什么问题吧,要是进化树能解释得清楚就行。不过如果你的重点是100那个分支,那就太单薄了,需要多补充一些数据。...

我就是想做一下我这株菌的16SrDNA的进化树
6楼2014-12-02 14:52:29
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万木有灵

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

100就是两条序列的相似度为100,就是说一模一样
7楼2015-01-23 17:13:49
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可信的程度,越大巨额解禁
8楼2015-01-23 21:34:20
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dujincheng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

100叫系统发育数可信度自给值,是统计学的结果。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
万物看似随机,但都有其定律。
9楼2015-01-23 22:44:46
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