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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 核心序列比对
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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

[求助] 核心序列比对 已有2人参与

#求助#，已知一段核心序列，能通过什么数据库或者比对方式能找到包含这段核心序列的基因有哪些？主要是拟南芥基因
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天道酬勤
1楼 2014-11-26 11:39:13
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江南神韵

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-11-26 14:14:42
到Genbank里面选择nucleotide数据库进行blastn比对

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一个人缺什么就会吹嘘什么，就像我的头衔“情感专家、励志大师、生活能手、学术帝、正能量…”可事实是我在这些方面一踏糊涂！你看我又在吹嘘自己没有这些头衔了
2楼2014-11-26 13:00:32
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-11-26 14:14:49
到ncbi的blast（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）页面，选择BLAST Assembled Genomes下的arabidopsis，在打开的新blastn页面中直接输入核心序列作比对。
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3楼2014-11-26 13:06:03
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