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西风的安逸

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于基因序列比对

本人现在拿到了油菜中许多功能未知的基因片段,想知道各个片段参与到了哪些代谢途径怎么操作啊,急急急,多谢各位了
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既然选择了远方就要风雨兼程
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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西风的安逸: 金币+3, 有帮助 2012-07-19 10:21:38
你的这个问题太大了,我给你个文档先看看吧.
How to analyze a new gene
How to analyze a new gene.pdf
http://kuai.xunlei.com/d/GVAHFCHZUXPM?p=130497
coasttocoast。
2楼2012-07-18 22:11:30
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西风的安逸

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-18 22:11:30
你的这个问题太大了,我给你个文档先看看吧.
How to analyze a new gene
How to analyze a new gene.pdf
http://kuai.xunlei.com/d/GVAHFCHZUXPM?p=130497

谢谢你的回复。不过我是随机找到了许多基因片段,想要预测它们都有什么功能,参与了哪些代谢通路,会与哪些基因互作,并不是要验证它有什么功能,请问应该怎么弄呢?谢谢啦
既然选择了远方就要风雨兼程
3楼2012-07-19 10:25:45
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tupac225

金虫 (正式写手)

目前进行基因功能验证主要通过第三方软件进行验证,我所熟悉的验证软件有:①GO(Gene Ontology ,http://www.geneontology.org/),里面有很多其他的软件,如GOstat、g_Profiler等;②IPA(Ingenuity Pathway Analysis Software,http://www.ingenuity.com/);③GSEA((Gene Set Enrichment Analysis,http://www.broadinstitute.org/gsea/downloads.jsp)。以上三个软件都是一些统计软件,一个基因的具体功能可参见NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),输入基因名就可以查看详细的功能和相关文献。
coasttocoast。
4楼2012-07-19 11:16:22
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西风的安逸

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-19 11:16:22
目前进行基因功能验证主要通过第三方软件进行验证,我所熟悉的验证软件有:①GO(Gene Ontology ,http://www.geneontology.org/),里面有很多其他的软件,如GOstat、g_Profiler等;②IPA(Ingenuity Pathway Anal ...

谢谢,那如果我有很多基因,那我怎么样才能知道他们是否有关联呢,如何去构建它们的代谢调控通路呢???
既然选择了远方就要风雨兼程
5楼2012-07-19 16:19:33
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