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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 关于基因序列比对
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西风的安逸

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于基因序列比对

本人现在拿到了油菜中许多功能未知的基因片段，想知道各个片段参与到了哪些代谢途径怎么操作啊，急急急，多谢各位了
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既然选择了远方就要风雨兼程
1楼 2012-07-18 19:48:09
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tupac225

金虫 (正式写手)
目前进行基因功能验证主要通过第三方软件进行验证，我所熟悉的验证软件有：①GO（Gene Ontology ，http://www.geneontology.org/），里面有很多其他的软件，如GOstat、g_Profiler等；②IPA（Ingenuity Pathway Analysis Software，http://www.ingenuity.com/）；③GSEA（(Gene Set Enrichment Analysis，http://www.broadinstitute.org/gsea/downloads.jsp）。以上三个软件都是一些统计软件，一个基因的具体功能可参见NCBI（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/），输入基因名就可以查看详细的功能和相关文献。
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coasttocoast。
4楼2012-07-19 11:16:22
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西风的安逸: 金币+3, ★有帮助 2012-07-19 10:21:38
你的这个问题太大了，我给你个文档先看看吧.
How to analyze a new gene
How to analyze a new gene.pdf
http://kuai.xunlei.com/d/GVAHFCHZUXPM?p=130497
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coasttocoast。
2楼2012-07-18 22:11:30
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西风的安逸

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-18 22:11:30
你的这个问题太大了，我给你个文档先看看吧.
How to analyze a new gene
How to analyze a new gene.pdf
http://kuai.xunlei.com/d/GVAHFCHZUXPM?p=130497

谢谢你的回复。不过我是随机找到了许多基因片段，想要预测它们都有什么功能，参与了哪些代谢通路，会与哪些基因互作，并不是要验证它有什么功能，请问应该怎么弄呢？谢谢啦
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既然选择了远方就要风雨兼程
3楼2012-07-19 10:25:45
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西风的安逸

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-19 11:16:22
目前进行基因功能验证主要通过第三方软件进行验证，我所熟悉的验证软件有：①GO（Gene Ontology ，http://www.geneontology.org/），里面有很多其他的软件，如GOstat、g_Profiler等；②IPA（Ingenuity Pathway Anal ...

谢谢，那如果我有很多基因，那我怎么样才能知道他们是否有关联呢，如何去构建它们的代谢调控通路呢？？？
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既然选择了远方就要风雨兼程
5楼2012-07-19 16:19:33
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