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MSP引物结合区域部分甲基化
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因为MSP是通过设计2条不同的引物来扩增,甲基化引物能扩出则为此CpG位点甲基化,非甲基化引物能扩出则为此位点非甲基化, 这里有2对引物 甲基化正义链 5-TTTGGGTTAAGTTAGG CGTCGT CG-3 甲基化反义链 5-ACACTACTCCTCGTACGACTCCG 非甲基化正义链 5-TTTGGGTTAAGTTAGG TGTCGT TG-3 非甲基化反义链 5-ACACTACTCCTCATACAACTCCA 甲基化正义与非甲基化正义链有2个碱基不同,甲基化反义与非甲基化反义有3个碱基不同,一共是5个位点。如5个位点同时甲基化则能被甲基化引物扩出,同时非甲基化则能被非甲基化引物扩出,但如5个位点的其中3或4个甲基化了,引物甲基化和非甲基化引物都结合不上模板,会不会2个引物都不能扩出? |
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