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liuzi919

银虫 (正式写手)

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[求助] 如何找到DNA甲基化的位点已有1人参与

知道一条DNA序列，怎么知道序列中的哪些点是甲基化位点呢？有没有什么网站可以知道？

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1楼 2014-01-04 10:13:14

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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liuzi919: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2014-01-04 20:25:12
gyesang: 金币+5, 鼓励交流！ 2014-01-05 16:02:25

MethDB (http://www.methdb.de)
DNA甲基化和环境表观遗传效应的数据库，截止到2009年9月，已经提交了20236份5mC数据和6312份甲基化谱数据。

PubMeth(http://www.pubmeth.org)
PubMeth是经过文本挖掘相关文献和人工校正过的甲基化数据库，主要是癌症领域的数据。

TCGA Data Portal (http://cancergenome.nih.gov/dataportal)
The Cancer Genome Atlas的数据接口，可以下载癌症基因组的各种数据，包括甲基化数据。

BDPC (http://biochem.jacobs-university.de/BDPC)
BDPC是在线DNA甲基化分析平台，完成初步的重亚硫酸盐测序分析，编辑和网上展示甲基化数据，并聚类不同样本的甲基化数据。

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liuzi919

2楼2014-01-04 12:01:59

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liuzi919

银虫 (正式写手)

送红花一朵

引用回帖:

2楼: Originally posted by Davidzjy at 2014-01-04 12:01:59
MethDB (http://www.methdb.de)
DNA甲基化和环境表观遗传效应的数据库，截止到2009年9月，已经提交了20236份5mC数据和6312份甲基化谱数据。

PubMeth(http://www.pubmeth.org)
PubMeth是经过文本挖掘相关文献和 ...