应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 系统发育树构建出来效果不理想，求助，谢谢！
71/1返回列表
查看: 1431  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yin1110

铜虫 (小有名气)

[求助] 系统发育树构建出来效果不理想，求助，谢谢！ 已有4人参与

各位高人，我分离鉴定腐败菌，将5个未知菌株通过PCR扩增测序后，NCBI上比对，分别下载了1-2个序列，将所有序列放一起做系统发育树，但结果不理想。求助，谢谢你们！

系统发育树构建出来效果不理想，求助，谢谢！
7.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

微生物

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-11-15 13:41:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yin1110

铜虫 (小有名气)
坐等大神
回复此楼
2楼2014-11-15 15:41:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xlwujian520

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励新虫应助！ 2014-12-02 21:00:13
是不是没注意全基因序列还是截取的个片段？注意截取的片段是不是和自己的片段一样长.再作比对。建议多搜索一些片段，然后找到和自己目的片段长度一样的种属进行进化分析
赞一下 回复此楼
做最好的自己
3楼2014-12-02 19:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fqingyang15

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

虽然我懂，但是我要帮你上去
赞一下 回复此楼
中国总代-Crystalaser激光器;TMC隔振平台;EXCITON染料，AVESTA飞秒，block量子级联，EDMUND/newport/thorlabs光学光电实验仪器设备！
4楼2014-12-02 21:56:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

竹子小小

木虫 (小有名气)
楼主用的是什么软件和哪个模型做的，一般我是用mega5，k-2模型，bootstrap值1000来做，还有细菌的序列最好是用已发表的典型菌株来做比对的，你最好去ezbiocloud上面下序列吧，ncbi有点杂。
赞一下 回复此楼
5楼2014-12-03 08:26:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

开小猫

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我做16s的进化树也是去ezbiocloud下序列，多下一些序列做的话应该会好一些。
赞一下 回复此楼
6楼2014-12-05 15:36:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

离了枝头

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

确实感觉你的同源序列少了点。
赞一下 回复此楼
7楼2014-12-08 13:43:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yin1110 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 23:28 by cuPZTDXS3VOd
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-17 22:29 by cuPZTDXS3VOd
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +8 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 9/450 2026-09-17 22:05 by cuPZTDXS3VOd
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-17 15:27 by 0ngsZVSCTS7z
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:53 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 23jxep3nCNZb 2026-09-14 4/200 2026-09-17 13:51 by ObVzqQQh1rrE
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 23jxep3nCNZb 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:29 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 23jxep3nCNZb 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:27 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-17 12:39 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-17 12:29 by ObVzqQQh1rrE
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 5/250 2026-09-17 05:14 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-17 02:38 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-17 02:38 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 8/400 2026-09-17 01:38 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-16 22:26 by Tql5LQhh5rLK
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 17:12 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-16 02:23 by DgNGHc3h5tPl
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭