| 查看: 2384 | 回复: 14 | ||||
nanjizhou91木虫 (小有名气)
|
[求助]
DGGE微生物多样性，细菌和真菌引物的选择 已有4人参与
|
|||
|
我要做土壤微生物多样性的分析，采用DGGE的方法（好多人建议用高通量，但是本项试验只用测定优势菌即可，故选择DGGE），由于是刚开始接触，很多问题不太了解，有以下疑惑： 1.DGGE之后要进行克隆测序,那么细菌和真菌的引物用哪些好？ 2.经典引物338F/518R,好多人都说不能用于测序，那么341、907呢？也有人推荐27、1492？这些引物分别代表哪个区？ 3.真菌引物用GC-Fung和NS1能有好的测序效果吗？ 急用！！！非常感谢各位大神的鼎力相助！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 生工检测理论与实务 |
» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有16人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
-
基金不中，共勉
已经有3人回复
-
怎么查啊
已经有5人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有10人回复
-
我不理解！
已经有13人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有9人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有25人回复
-
2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？
已经有28人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有26人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 真菌多样性研究中引物选择问题~~~
已经有14人回复
- 好纠结 关于真菌DGGE测序结果
已经有14人回复
- pcr-dgge分析土壤微生物多样性
已经有8人回复
- 关于真菌18S在NCBI上BLAST问题
已经有8人回复
- 虐心的PCR-DGGE
已经有14人回复
- PCR和高通量的区别与选择
已经有15人回复
- 怎样从土壤中得到总的真菌？
已经有11人回复
- pcr-dgge分析土壤微生物群落要做平行样吗？
已经有6人回复
- T-RFLP技术中，真菌的PCR问题
已经有11人回复
- 丝状真菌ITS引物及PCR条件？
已经有10人回复
- 如何运用克隆文库法分析土壤真菌微生物多样性？
已经有8人回复
- 水体中微生物群落多样性分析
已经有8人回复
- 16S rRNA文库 引物的选择
已经有7人回复
- 土壤真菌PCR-DGGE中真菌ITS区引物的选择
已经有10人回复
- 关于PCR-DGGE技术，此技术能分析土壤中的真菌吗？用什么引物好？需要注意什么？
已经有19人回复
- PCR-DGGE技术寻求
已经有9人回复
- 请问大家做PCR-DGGE的时候 真菌细菌放线菌 分别用什么引物？ O(∩_∩)O谢谢
已经有13人回复
- 细菌引物 338F 518R 做DGGE之后 pcr
已经有9人回复
- 微生物多样性研究的几个问题
已经有10人回复
- 真菌ITS序列PCR扩增 求助
已经有9人回复
- 真菌长成这个样子，是什么情况？
已经有17人回复
- 【求助/交流】细菌16SDNA的通用引物
已经有12人回复
- 【求助/交流】细菌V3区PCR出现问题，引物为357和518，用于DGGE！
已经有8人回复
【答案】应助回帖
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nanjizhou91(dllchina代发): 金币+3, good 2014-09-24 10:01:57
nanjizhou91: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-09-24 10:36:43
感谢参与，应助指数 +1
nanjizhou91(dllchina代发): 金币+3, good 2014-09-24 10:01:57
nanjizhou91: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-09-24 10:36:43
|
1、做DGGE原核微生物多样性分析的引物用的比较多的是：338F和518R (V3区) 真菌的引物做的比较多的是V4区和ITS（具体引物序列可以查找相关文献） 2、“不能用于测序”这句话，我不是很明白你的意思。341F、907R是V3-V5区，27F、1492R是V1-V9区。 3、这些引物没有用过，具体怎样没法告知。 建议：如果你打算采用DGGE分析土壤微生物多样性的话，扩增片段不要过长或者过短。因为DGGE只能对200-700bp的片段有效地分离，过大或者过小的片段分离效果都不是很好。 以上是本人拙见，供你参考。 |
3楼2014-09-24 09:51:35
nanjizhou919楼2014-09-25 11:20:36
nanjizhou91
木虫 (小有名气)
 |
2楼2014-09-23 17:09:51
nanjizhou91
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2758.8
- 帖子: 151
- 在线: 38.9小时
- 虫号: 2840019
- 注册: 2013-12-01
- 性别: MM
- 专业: 作物栽培与耕作学
4楼2014-09-24 10:38:11
nanjizhou91
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2758.8
- 帖子: 151
- 在线: 38.9小时
- 虫号: 2840019
- 注册: 2013-12-01
- 性别: MM
- 专业: 作物栽培与耕作学
5楼2014-09-24 10:38:58
6楼2014-09-24 16:36:41
7楼2014-09-24 16:38:05
nanjizhou91
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2758.8
- 帖子: 151
- 在线: 38.9小时
- 虫号: 2840019
- 注册: 2013-12-01
- 性别: MM
- 专业: 作物栽培与耕作学
8楼2014-09-24 20:15:11
nanjizhou91
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2758.8
- 帖子: 151
- 在线: 38.9小时
- 虫号: 2840019
- 注册: 2013-12-01
- 性别: MM
- 专业: 作物栽培与耕作学
10楼2014-09-25 16:13:05
投票:
