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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 好纠结 关于真菌DGGE测序结果
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er66668888

铜虫 (初入文坛)

[求助] 好纠结 关于真菌DGGE测序结果已有4人参与

用真菌18s特异的通用引物NS1/GCFUNG做土壤样品DNA的DGGE，条带拿去测序，共测了24条 就一条是壶菌 其余都是藻类和环节动物 我们是在土壤里有放养沙蚕的 最亮的那条条带测出来居然是沙蚕的 是引物不行还是真菌本来就很少啊 这结果还能用吗
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1楼2014-07-02 18:52:01
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

happy6

木虫 (著名写手)
18SrRNA基因本来就是真核生物就有的，不是只针对真菌的，建议楼主选用你想研究的真菌的特异性的引物去做实验。
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4楼2014-07-03 09:02:08
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lhf903

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
土样没处理好，提的DNA代表性不行
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2楼2014-07-02 19:30:20
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er66668888

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lhf903 at 2014-07-02 19:30:20
土样没处理好，提的DNA代表性不行

那要怎么处理土样啊 我的是淤泥

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2014-07-02 22:15:35
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er66668888

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by happy6 at 2014-07-03 09:02:08
18SrRNA基因本来就是真核生物就有的，不是只针对真菌的，建议楼主选用你想研究的真菌的特异性的引物去做实验。

这个就是真菌特异的引物 很多文献都有用 论坛里也是
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5楼2014-07-03 10:36:22
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lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by er66668888 at 2014-07-02 22:15:35
那要怎么处理土样啊 我的是淤泥
...

淤泥就比较难办了~都混在一起，分不开了
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6楼2014-07-03 12:02:00
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kkunny

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
做真菌试试GC-fung和NSI这对引物。
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好好学习，天天向上
7楼2014-07-03 21:54:39
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er66668888

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by kkunny at 2014-07-03 21:54:39
做真菌试试GC-fung和NSI这对引物。

😓我用的不就是这对引物吗

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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8楼2014-07-04 11:21:41
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ccdeweidao

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
淤泥的DNA是用什么提取的呀，应该得用处理土壤的专用试剂盒提取吧
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9楼2014-07-05 08:48:34
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er66668888

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by ccdeweidao at 2014-07-05 08:48:34
淤泥的DNA是用什么提取的呀，应该得用处理土壤的专用试剂盒提取吧

MOBIO土壤试剂盒

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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10楼2014-07-05 10:56:21
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