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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 好纠结 关于真菌DGGE测序结果
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er66668888

铜虫 (初入文坛)

[求助] 好纠结 关于真菌DGGE测序结果已有4人参与

用真菌18s特异的通用引物NS1/GCFUNG做土壤样品DNA的DGGE，条带拿去测序，共测了24条 就一条是壶菌 其余都是藻类和环节动物 我们是在土壤里有放养沙蚕的 最亮的那条条带测出来居然是沙蚕的 是引物不行还是真菌本来就很少啊 这结果还能用吗
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1楼2014-07-02 18:52:01
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ccdeweidao

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
淤泥的DNA是用什么提取的呀，应该得用处理土壤的专用试剂盒提取吧
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9楼2014-07-05 08:48:34
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ccdeweidao

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by er66668888 at 2014-07-05 10:56:21
MOBIO土壤试剂盒
...

我们实验室也做过土壤淤泥的真菌DGGE，用的也是这个引物，没出现你说的这个问题。你提DNA条带亮度以及上DGGE前跑琼脂糖电泳的条带亮度什么的正常吗
赞一下 回复此楼
11楼2014-07-05 16:31:22
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