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怎样通过蛋白质序列寻找DNA序列?求方法啊,急。。。
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馨-馨
银虫
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MM
专业: 生物大分子结构与功能
[
求助
]
怎样通过蛋白质序列寻找DNA序列?求方法啊,急。。。
已有5人参与
本人现在在NCBI上找到一个蛋白质序列,怎样才能找到这个蛋白质的核酸序列?求各位大神支招啊。。。。
目前本人用NTI进行反转,反转出来的核酸序列在NCBI上比对不到我所需要的,我该怎么办?
难道真的要根据密码子偏好性,人工一个一个反转出来吗???
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1楼
2014-09-14 14:33:38
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wizardfan
至尊木虫
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2014-09-15 20:59:38
1. 选择CDS等和DNA相关的选项
2. 在crossref栏下找
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4楼
2014-09-15 09:06:24
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冼亮淀粉酶
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2014-09-15 20:59:17
鼠标左键单击页面左侧的"CDS",就会出现CDS了。
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(1人)
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流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼
2014-09-14 14:39:33
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liuderong
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2014-09-15 20:59:30
NCBI的blast里头有一种tblastn,就是用蛋白质找CDS的。
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
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3楼
2014-09-14 17:51:19
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王平阳
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2014-09-15 20:59:47
你BLAST之后不是给了一个基因登录号吗?根据这个登录号就可以找到该基因的相关信息啊!
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没有做不到,只有想不到!
5楼
2014-09-15 15:01:15
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