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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 通过质谱获得了一株菌的全蛋白质组序列信息，如何确定这些蛋白的功能信息
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wwyymm_6

银虫 (初入文坛)

[求助] 通过质谱获得了一株菌的全蛋白质组序列信息，如何确定这些蛋白的功能信息

紧急求助：通过质谱技术，获得了一株菌的大量蛋白质序列信息，如何才能确定这些蛋白序列的功能喝分类呢？怎么查找参与某一代谢途径的蛋白？谢谢
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1楼 2012-08-15 16:54:29
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eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先你要过滤和通过统计学方法选定哪些蛋白是可信、可用的， 然后选查的感兴趣的蛋白参与的代谢途径  推荐一个网站 http://www.genome.jp/kegg/pathway.html
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2楼2012-08-16 09:49:52
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363965412

新虫 (初入文坛)
推荐网站：http://www.expasy.ch/   本人用过  比较详细！
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3楼2012-08-16 10:52:57
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wwyymm_6

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2012-08-16 09:49:52
首先你要过滤和通过统计学方法选定哪些蛋白是可信、可用的， 然后选查的感兴趣的蛋白参与的代谢途径  推荐一个网站 http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

不好意思，能详细一点吗？我只是想找到这些蛋白中有哪些蛋白参与氨氧化过程
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4楼2012-08-16 17:17:10
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eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by wwyymm_6 at 2012-08-16 17:17:10
不好意思，能详细一点吗？我只是想找到这些蛋白中有哪些蛋白参与氨氧化过程...

你有该菌种的全基因序列么？ 如果有 就先再基因组里找哪些蛋白参与了氨氧化过程， 然后再去看你打出来的质谱里有没有这些蛋白
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5楼2012-08-16 19:00:12
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wwyymm_6

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by eagles123 at 2012-08-16 19:00:12
你有该菌种的全基因序列么？ 如果有 就先再基因组里找哪些蛋白参与了氨氧化过程， 然后再去看你打出来的质谱里有没有这些蛋白...

谢谢，有全基因组序列
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6楼2012-08-16 19:24:51
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