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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 怎样通过蛋白质序列寻找DNA序列？求方法啊，急。。。
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馨-馨

银虫 (小有名气)

[求助] 怎样通过蛋白质序列寻找DNA序列？求方法啊，急。。。 已有5人参与

本人现在在NCBI上找到一个蛋白质序列，怎样才能找到这个蛋白质的核酸序列？求各位大神支招啊。。。。
目前本人用NTI进行反转，反转出来的核酸序列在NCBI上比对不到我所需要的，我该怎么办？
难道真的要根据密码子偏好性，人工一个一个反转出来吗？？？
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1楼 2014-09-14 14:33:38
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
馨-馨: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-09-15 20:59:17
鼠标左键单击页面左侧的"CDS"，就会出现CDS了。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2014-09-14 14:39:33
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
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馨-馨: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-09-15 20:59:30
NCBI的blast里头有一种tblastn，就是用蛋白质找CDS的。http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
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3楼2014-09-14 17:51:19
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
馨-馨: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-09-15 20:59:38
1. 选择CDS等和DNA相关的选项
2. 在crossref栏下找
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4楼2014-09-15 09:06:24
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
馨-馨: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-09-15 20:59:47
你BLAST之后不是给了一个基因登录号吗？根据这个登录号就可以找到该基因的相关信息啊！
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没有做不到，只有想不到！
5楼2014-09-15 15:01:15
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ashine

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
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馨-馨: 金币+1, ★★★★★最佳答案 2014-09-18 13:41:46
蛋白质的相关信息在UniProt(www.uniprot.org)中更全面，包含了序列、结构和编码的基因等。用NCBI中蛋白质的登录号可以在UniProt检索到对应的蛋白质，其信息中的Cross-references就有编码的核酸链接。
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6楼2014-09-17 10:39:17
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