| 查看: 3392 | 回复: 5 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
xmc!.金虫 (正式写手)
|
[求助]
知道肽序列，如何查找数据库
|
|
| 问题：从水稻中分离、鉴定出一种肽，比如序列是Met-Pro-Ser。现在想验证下我的鉴定结果，想反查水稻的基因序列中是否有这种肽的编码，也就是说Met-Pro-Ser这个肽有没有可能来自水稻。如何查？知道有些数据库，比如SwissProt，但不会用。请指点。不胜感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种?
已经有5人回复
-
《灰分记：我与坩埚的“灰烬”之恋》
已经有3人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有243人回复
-
求助 食品检验工（基础知识），中国劳动社会出版社 电子版
已经有5人回复
-
胶体几丁质的结晶度？
已经有0人回复
-
诚挚招收全日制博士！！！中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士
已经有2人回复
-
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
拟南芥核基因编码蛋白，定位于叶绿体。已知氨基酸序列，怎么找到前导肽？
已经有6人回复- 已知蛋白序列求编码基因序列
已经有3人回复
- 如何确定一段序列中那一部分是启动子
已经有7人回复
- 测序结果显示连上了，但是序列不对，连上的序列数据库中找不到，怎么回事
已经有3人回复
- 怎样分析基因组序列？
已经有7人回复
- 蛋白序列的BLAST
已经有4人回复
- 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？
已经有11人回复
- 求助——genbank基因组序列的查询
已经有4人回复
- 已知基因的氨基酸序列，怎么在NCBI上找到核苷酸序列啊~~
已经有9人回复
- 如何查找一段基因序列的启动子？
已经有3人回复
- 已知蛋白质38KD，如何获得其全长基因序列？
已经有10人回复
- 如何找到水稻一段序列的上下游序列？
已经有5人回复
- 已知一段启动子序列，如何查找它可能在哪些基因中起作用
已经有4人回复
- 知道miRNA的成熟序列，怎么查找它的前体序列啊？
已经有20人回复
- 如何找到所有蛋白质的AA序列
已经有6人回复
- 请问在GenBank上找到了一条序列，怎样知道作者所用引物的序列？
已经有9人回复
- 用什么方法去除一个基因中的一段序列
已经有11人回复
- 怎样在NCBI中查找一物种的全基因组？
已经有12人回复
- 【求助/交流】基因位点序列查询求助！
已经有3人回复
- 【求助】知道CAS号，数据库查不到文献，如何查找合成方法？
已经有18人回复
- 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。
已经有17人回复
xmc!.
金虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1154.8
- 散金: 1251
- 红花: 22
- 帖子: 652
- 在线: 142.1小时
- 虫号: 587615
- 注册: 2008-08-22
- 专业: 食品科学基础
5楼2014-09-04 08:42:53
2楼2014-09-03 19:40:15
xmc!.
金虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1154.8
- 散金: 1251
- 红花: 22
- 帖子: 652
- 在线: 142.1小时
- 虫号: 587615
- 注册: 2008-08-22
- 专业: 食品科学基础
4楼2014-09-04 08:41:04
★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-09-04 19:38:18
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-09-04 19:38:18
|
应该用blastp，1、BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。 2、BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。 3、BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。 4、TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。 5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列），这样每次比对会产生36种比对阵列。 |
6楼2014-09-04 09:32:20