24小时热门版块排行榜    

查看: 3424  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xmc!.

金虫 (正式写手)

[求助] 知道肽序列,如何查找数据库

问题:从水稻中分离、鉴定出一种肽,比如序列是Met-Pro-Ser。现在想验证下我的鉴定结果,想反查水稻的基因序列中是否有这种肽的编码,也就是说Met-Pro-Ser这个肽有没有可能来自水稻。如何查?知道有些数据库,比如SwissProt,但不会用。请指点。不胜感激!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmc!.

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liyaid at 2014-09-03 19:40:15
登陆NCBI,利用里面的Blastp,输入你的序列,在水稻库里搜索就可以了~~

你好,非常感谢回复。但是我查了下还是查不出来,我是按照你说的方法找的,给指导下在哪地方出了问题:
知道肽序列,如何查找数据库
0.png


知道肽序列,如何查找数据库-1
1.png


知道肽序列,如何查找数据库-2
2.png


知道肽序列,如何查找数据库-3
3.png

4楼2014-09-04 08:41:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmc!.

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liyaid at 2014-09-03 19:40:15
登陆NCBI,利用里面的Blastp,输入你的序列,在水稻库里搜索就可以了~~

我输入过不同的氨基酸序列,确保是水稻中含有的序列,还是没查出来,帮忙分析下吧,谢谢。
5楼2014-09-04 08:42:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xmc!. 的主题更新
信息提示
请填处理意见