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知道肽序列,如何查找数据库
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知道肽序列,如何查找数据库
问题:从水稻中分离、鉴定出一种肽,比如序列是Met-Pro-Ser。现在想验证下我的鉴定结果,想反查水稻的基因序列中是否有这种肽的编码,也就是说Met-Pro-Ser这个肽有没有可能来自水稻。如何查?知道有些数据库,比如SwissProt,但不会用。请指点。不胜感激!
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2014-09-03 17:30:50
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2楼
:
Originally posted by
liyaid
at 2014-09-03 19:40:15
登陆NCBI,利用里面的Blastp,输入你的序列,在水稻库里搜索就可以了~~
你好,非常感谢回复。但是我查了下还是查不出来,我是按照你说的方法找的,给指导下在哪地方出了问题:
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4楼
2014-09-04 08:41:04
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2楼
:
Originally posted by
liyaid
at 2014-09-03 19:40:15
登陆NCBI,利用里面的Blastp,输入你的序列,在水稻库里搜索就可以了~~
我输入过不同的氨基酸序列,确保是水稻中含有的序列,还是没查出来,帮忙分析下吧,谢谢。
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5楼
2014-09-04 08:42:53
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