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汕头大学海洋科学接受调剂
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dongabcde

银虫 (小有名气)

[求助] 关于Dmol3优化过渡态搜索问题

各位好,最近一直再用dmol 搜索过渡态,但是遇到好多的问题,我是算的有机小分子在金属表面上氧化反应机理,
1,首先我用DMOL来优化反应物在金属表面的稳定的吸附构型,但是老是计算出现错误,提示如下:
Error: SCF iterations not converged in   50 iterations       DELTE =  -5.000000000000000E-003
Message: SCF not converging. Choose larger smearing value in DMol3 SCF panel
or modify/delete "Occupation  Thermal" in the input file.
You may also need to change spin or use symmetry.
Resubmit DMol3.
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
后来没办法只好用Castep 算出有机分子在pt(111)面上的结构优化后的构型,结果发现构型基本上就没大变化,但是也能算出来吸附能,不知道我这样算是否合适,能不能保证是最稳定的吸附位?
2,然后我再将反应物和产物进行原子配对,配对之后用DMOL 来搜索过渡态,结果一直出现不收敛,一直出下面提示;
   Message: DMol3 job failed
   Error: DMol3 exiting
   Error: SCF iterations not converged in  100 iterations
我改变那个迭代次数改到了400还是出现上面的提示,一直是不收敛的。我把我建立的模型都在附件里面呈现了,请问各位大侠,能不能给在下提一些意见,被这些问题困惑了好长时间了,在线等热心人帮助。我们这边没有用DMOL计算的,老师也不是搞这个的。全是靠一个人在小木虫上寻求帮助。期待好心人。。
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  • 2014-07-21 21:29:13, 537 K

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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
7楼: Originally posted by dongabcde at 2014-07-22 12:17:57
谢谢你,那我就把迭代次数调大一些试试,你说还有可能是我的k点或者smearing 数值设的不对麽?我也是看的一个文献上数值参考了一下,但是吸附的有机物不一样,想问一下smearing最大能设多大,...

你的问题不仅仅只是调大迭代步数,重点在于前面的问题,否则算出来的结果都是错的。

你确定文献上的一定是对的?一般希望smearing尽可能小,而不是尽量希望大,使得输出文件的kTeS项忽略不计,一般这个忽略不计按照VASP程序手册认为是0.1meV/atom的大小。能量计算在使用了smearing也应该取外推到0K的binding energy。

电子自洽收敛困难的解决方式很多,smearing可以解决,但是其初衷并不是为了这个,并且会影响到能量的计算。

一般难收敛的情况可以调整charge mix和DIIS,使得计算的收敛趋势和收敛速度达到平衡。通常调整这两项就足以解决大部分问题。其他的只能是特殊情况特殊处理。

老师不做指导,让学生做,对这种情况特别反感。尤其是硕士生,未必有那么好的判断力。对这种情况超头疼。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
8楼2014-07-22 12:41:14
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查看全部 10 个回答

dongabcde

银虫 (小有名气)

希望有哪位高手帮帮我,自己顶起来,感激不尽
2楼2014-07-21 21:40:17
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

请把dmol优化结构出错的outmol完整传上来,这样才能诊断。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-07-21 23:41:16
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dongabcde

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-07-21 23:41:16
请把dmol优化结构出错的outmol完整传上来,这样才能诊断。

我把outmol文件上传了,麻烦你能帮着看一下。再次感谢
4楼2014-07-22 09:36:58
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