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dongabcde银虫 (小有名气)
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关于Dmol3优化过渡态搜索问题
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各位好，最近一直再用dmol 搜索过渡态，但是遇到好多的问题，我是算的有机小分子在金属表面上氧化反应机理， 1，首先我用DMOL来优化反应物在金属表面的稳定的吸附构型，但是老是计算出现错误，提示如下： Error: SCF iterations not converged in 50 iterations DELTE = -5.000000000000000E-003 Message: SCF not converging. Choose larger smearing value in DMol3 SCF panel or modify/delete "Occupation Thermal" in the input file. You may also need to change spin or use symmetry. Resubmit DMol3. Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting 后来没办法只好用Castep 算出有机分子在pt（111）面上的结构优化后的构型，结果发现构型基本上就没大变化，但是也能算出来吸附能，不知道我这样算是否合适，能不能保证是最稳定的吸附位？ 2，然后我再将反应物和产物进行原子配对，配对之后用DMOL 来搜索过渡态，结果一直出现不收敛，一直出下面提示； Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting Error: SCF iterations not converged in 100 iterations 我改变那个迭代次数改到了400还是出现上面的提示，一直是不收敛的。我把我建立的模型都在附件里面呈现了，请问各位大侠，能不能给在下提一些意见，被这些问题困惑了好长时间了，在线等热心人帮助。我们这边没有用DMOL计算的，老师也不是搞这个的。全是靠一个人在小木虫上寻求帮助。期待好心人。。 |
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2014-07-21 21:29:13, 537 K
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这是出错的outmol，麻烦你给看一下谢谢 |
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你的问题不仅仅只是调大迭代步数，重点在于前面的问题，否则算出来的结果都是错的。 你确定文献上的一定是对的？一般希望smearing尽可能小，而不是尽量希望大，使得输出文件的kTeS项忽略不计，一般这个忽略不计按照VASP程序手册认为是0.1meV/atom的大小。能量计算在使用了smearing也应该取外推到0K的binding energy。 电子自洽收敛困难的解决方式很多，smearing可以解决，但是其初衷并不是为了这个，并且会影响到能量的计算。 一般难收敛的情况可以调整charge mix和DIIS，使得计算的收敛趋势和收敛速度达到平衡。通常调整这两项就足以解决大部分问题。其他的只能是特殊情况特殊处理。 老师不做指导，让学生做，对这种情况特别反感。尤其是硕士生，未必有那么好的判断力。对这种情况超头疼。 |
8楼2014-07-22 12:41:14
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