24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3093  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

[求助] 关于Dmol3优化过渡态搜索问题

各位好,最近一直再用dmol 搜索过渡态,但是遇到好多的问题,我是算的有机小分子在金属表面上氧化反应机理,
1,首先我用DMOL来优化反应物在金属表面的稳定的吸附构型,但是老是计算出现错误,提示如下:
Error: SCF iterations not converged in   50 iterations       DELTE =  -5.000000000000000E-003
Message: SCF not converging. Choose larger smearing value in DMol3 SCF panel
or modify/delete "Occupation  Thermal" in the input file.
You may also need to change spin or use symmetry.
Resubmit DMol3.
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
后来没办法只好用Castep 算出有机分子在pt(111)面上的结构优化后的构型,结果发现构型基本上就没大变化,但是也能算出来吸附能,不知道我这样算是否合适,能不能保证是最稳定的吸附位?
2,然后我再将反应物和产物进行原子配对,配对之后用DMOL 来搜索过渡态,结果一直出现不收敛,一直出下面提示;
   Message: DMol3 job failed
   Error: DMol3 exiting
   Error: SCF iterations not converged in  100 iterations
我改变那个迭代次数改到了400还是出现上面的提示,一直是不收敛的。我把我建立的模型都在附件里面呈现了,请问各位大侠,能不能给在下提一些意见,被这些问题困惑了好长时间了,在线等热心人帮助。我们这边没有用DMOL计算的,老师也不是搞这个的。全是靠一个人在小木虫上寻求帮助。期待好心人。。
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : wenti.doc
  • 2014-07-21 21:29:13, 537 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-07-22 11:12:15
我简单看了一下,首先,如Pt原子需要采用赝势,ecp或dspp,在core treatment选择effective core或DFT semi-core。
medium的精度是靠不住的,建议采用fine的精度。
另外就是新手尤其是对dmol的用户要注意的就是k和 ...

谢谢你,那我就把迭代次数调大一些试试,你说还有可能是我的k点或者smearing 数值设的不对麽?我也是看的一个文献上数值参考了一下,但是吸附的有机物不一样,想问一下smearing最大能设多大,
7楼2014-07-22 12:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

dongabcde

银虫 (小有名气)

希望有哪位高手帮帮我,自己顶起来,感激不尽
2楼2014-07-21 21:40:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

请把dmol优化结构出错的outmol完整传上来,这样才能诊断。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-07-21 23:41:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongabcde

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-07-21 23:41:16
请把dmol优化结构出错的outmol完整传上来,这样才能诊断。

我把outmol文件上传了,麻烦你能帮着看一下。再次感谢
4楼2014-07-22 09:36:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291分调剂 +5 上岸小莹加油 2026-04-09 6/300 2026-04-11 21:06 by 逆水乘风
[考研] 087100初试311求调剂 +4 任雅琴 2026-04-09 4/200 2026-04-11 10:33 by zhq0425
[考研] 还有化工二轮调剂的学校吗 5+14 化工人999 2026-04-09 48/2400 2026-04-11 10:27 by 89436494
[考研] 调剂 化学 307 +21 73372112 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 23:53 by wj165256
[考研] 302分求调剂 +9 凡语祈愿 2026-04-08 10/500 2026-04-10 23:26 by 314126402
[材料工程] 材料调剂推荐 +8 蛋糕x2 2026-04-07 8/400 2026-04-10 23:13 by Ftglcn90
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +21 好好休息好不好 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 16:58 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西交机械专硕求调剂 +8 求上岸的小王 2026-04-10 8/400 2026-04-10 15:09 by hemengdong
[考研] 347材料专硕求调剂 +19 zj8215216 2026-04-06 19/950 2026-04-10 09:36 by 690616278
[考研] 求调剂 +15 张zic 2026-04-05 16/800 2026-04-10 08:12 by kangsm
[考研] 生物学求调剂 一志愿沪9,326分 +7 刘墨墨 2026-04-06 7/350 2026-04-10 08:11 by kangsm
[考研] 求调剂希望还是希望在山河四省附近 +3 快乐的小白鸽 2026-04-05 3/150 2026-04-09 17:36 by wp06
[考研] 270求调剂 +3 031127 2026-04-06 4/200 2026-04-08 21:00 by 逆水乘风
[考研] 0703化学调剂 348分 +14 唉我超真没招了 2026-04-06 15/750 2026-04-08 19:16 by 我减肥1
[考研] 298求调剂 +4 manman511 2026-04-05 4/200 2026-04-08 16:50 by tjzhao
[考研] 一志愿华东理工085601材料工程303分求调剂 +15 a1708 2026-04-06 15/750 2026-04-08 16:23 by luoyongfeng
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +11 大火山小火山 2026-04-05 11/550 2026-04-06 22:55 by yunlongyang
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
[考研] 考研调剂生寻找导师 +3 顾瞻考研啊 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:18 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见