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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】DMol3优化参数的选择
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sunshine7788

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】DMol3优化参数的选择已有9人参与

没有可以参考的文献，
对一种新的分子结构进行优化时，
参数应如何确定？？
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1楼2010-04-05 09:02:10
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qli0218

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
sunshine7788(金币+1):O(∩_∩)O谢谢 2010-04-05 09:18
aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-04-05 09:19
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-05 14:13
一般先做动力学吧。优化的话先用精度粗一点的，得到满意的结构后再用精度高一点的优化。
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2楼2010-04-05 09:04:43
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sunshine7788

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by qli0218 at 2010-04-05 09:04:43:
一般先做动力学吧。优化的话先用精度粗一点的，得到满意的结构后再用精度高一点的优化。

关于泛函、基组及内核处理这些如何选取？
有没有必要把常用的设置都做一遍，选取最优的组合呢？？
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3楼2010-04-05 09:18:08
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★ ★
sunshine7788(金币+1):O(∩_∩)O谢谢 2010-04-05 09:25
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-05 14:13
先都选择默认试试，如果不成功看看出错的信息，再解决出错的问题
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
4楼2010-04-05 09:20:39
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sunshine7788

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2010-04-05 09:20:39:
先都选择默认试试，如果不成功看看出错的信息，再解决出错的问题

都能成功啊  而且也没有虚频
那我应该比较哪些数据才能选取一组合适的参数呢？
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5楼2010-04-05 09:24:41
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不眠人

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
qli0218(金币+1):谢谢 2010-04-05 11:04
sunshine7788(金币+1):O(∩_∩)O谢谢 2010-04-05 11:10
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-05 14:13
没什么特殊要求的话 精度选择中等就行，基组DND或DNP也行，关键看你算的什么体系，
给你提供以下我的参数：
对象：咪唑啉分子
精度：中等
基组：DNP
分析的参数：频率、轨道、布局分析、电荷
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6楼2010-04-05 10:00:20
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sunshine7788

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 不眠人 at 2010-04-05 10:00:20:
没什么特殊要求的话 精度选择中等就行，基组DND或DNP也行，关键看你算的什么体系，
给你提供以下我的参数：
对象：咪唑啉分子
精度：中等
基组：DNP
分析的参数：频率、轨道、布局分析、电荷

我的意思是 怎么样才能确定你优化出来的分子结构是正确的？

我试了几组参数，把得出来的键长键角与实验值做了对比，差的都不大，应该怎么选？
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7楼2010-04-05 11:12:56
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不眠人

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
gavinliu7390(金币+2):谢谢回答！ 2010-04-06 13:23
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-06 15:11
sunshine7788(金币+1):谢谢 呵呵 2010-04-06 19:03
引用回帖:
Originally posted by sunshine7788 at 2010-04-05 11:12:56:



我的意思是 怎么样才能确定你优化出来的分子结构是正确的？

我试了几组参数，把得出来的键长键角与实验值做了对比，差的都不大，应该怎么选？

首先必须保证没有虚频，然后最好能和文献上相关分子的优化结果比较一下(如果有的话)，差别不大应该就对了，我一般都是这样做的，不知道对不对，呵呵，有待探讨。
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8楼2010-04-06 12:39:17
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sunshine7788

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 不眠人 at 2010-04-06 12:39:17:


首先必须保证没有虚频，然后最好能和文献上相关分子的优化结果比较一下(如果有的话)，差别不大应该就对了，我一般都是这样做的，不知道对不对，呵呵，有待探讨。

这个我也知道啊   可就是因为没有文献可以参考   选起参数来才这么费力
有什么好建议多多交流  
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9楼2010-04-06 19:04:26
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qli0218

木虫 (小有名气)
★ ★
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-06 19:54
wuli8(金币+1):感谢 2010-04-10 19:23
sunshine7788(金币+1):O(∩_∩)O谢谢 2010-04-12 21:25
引用回帖:
Originally posted by sunshine7788 at 2010-04-06 19:04:26:



这个我也知道啊   可就是因为没有文献可以参考   选起参数来才这么费力
有什么好建议多多交流  

要不可以找找相似物质的实验结果对照一下。红外波数差得不大就可以吧，基本的有机化合物的大致波数都差不多吧。计算得到的红外结果对比一下看看。
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10楼2010-04-06 19:10:23
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