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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gamess/Q-Chem » 【求助】过渡态出现2个虚频
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pinebj

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】过渡态出现2个虚频 已有2人参与

大家好，
       我优化得到的过渡态做频率分析时有两个虚频，750i，115i，其中750i正是我要的，但是如何消除115i这个虚频呢？谢谢！
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1楼 2009-12-25 10:53:51
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
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erylingjet(金币+2,VIP+0):感谢交流 12-25 17:15
如果你有gview4.0以上的版本，打开log文件，显示频率，然后选中你不要的那个虚频，在最下面那个"Manual Displacement"，然后在拖动滑竿，或直接在右面文本框输入数字（一般在0.2-0.8）之间，我习惯用0.2或0.3,然后点击右面的存储按钮"Save Structure",，就会生成一个新的坐标文件gjf，用这个继续跑opt，不要的那个虚频多数都能去掉了。记住要4.0以上，3.x的版本没有这个功能，需要自己手工计算虚频的坐标，然后乘以一个系数（也就是我说的那个0.2或0.3）再去修改所有原子的坐标。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
5楼2009-12-25 15:32:28
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3867826

木虫 (著名写手)
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看看高斯FAQ里面的坐标消虚！
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拒稿，终于体会到了！乱写接受，认真写拒稿，这就是2和4的区别吗？
10楼2010-08-18 13:48:14
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普通回帖

lfengxia82

金虫 (小有名气)
★
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你可以用一个程序消去第二个虚频的
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2楼2009-12-25 11:18:46
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dukelr

金虫 (小有名气)
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额....LS说的是什么程序呢？
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3楼2009-12-25 14:31:12
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pinebj

金虫 (初入文坛)
什么程序?如何消除呢？
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4楼2009-12-25 15:07:23
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llhxaustin

木虫 (著名写手)
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erylingjet(金币+2,VIP+0):感谢交流 12-25 17:15
哦，给你一个更简单的方法。首先看清楚不要的那个虚频的振动方向，然后按照主要振动原子的振动方向将原子位移，这就会破坏那个虚频的振动，更多的时候是破坏了对称性。然后用新的坐标再优化时，就会得到正确的了。用Chem3D和GaussView都可以做，也可以根据虚频的相对各原子运动强度将位移直接加到最后的坐标中。
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6楼2009-12-25 15:42:54
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pinebj

金虫 (初入文坛)
Thanks a lot! I'll give it a try and see if I can fix it.
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7楼2009-12-25 21:51:55
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文新宇
8楼2009-12-26 09:31:40
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lijie110

新虫 (小有名气)

求助 过渡态虚频

★
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引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2009-12-25 15:32:28:
如果你有gview4.0以上的版本，打开log文件，显示频率，然后选中你不要的那个虚频，在最下面那个"Manual Displacement"，然后在拖动滑竿，或直接在右面文本框输入数字（一般在0.2-0.8）之间，我习惯用0. ...

你好，请问你那里有gview4.0以上的版本吗？能不能发给我一个....lihaojie110@sina.com  谢谢！！
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9楼2010-08-17 16:03:48
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