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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 两个反应物 生成两个产物 如何进行过渡态搜索
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cshcgy

金虫 (正式写手)

[求助] 两个反应物 生成两个产物 如何进行过渡态搜索

请问 用MS里的Dmol3搜索过渡态
例如A+B=C+D这种反应，如何进行过渡态搜索
是 将A、B、C、D分别优化，然后 A、B放在一起优化，C、D放在一起优化，确保虚频 ，然后匹配原子，TSsearch吗？
请高手指教！！多谢了

[ Last edited by cshcgy on 2011-7-20 at 20:13 ]
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1楼 2011-07-20 20:12:17
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bjdyadx

银虫 (小有名气)
我也为此事烦恼，希望有大牛能指教.........
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.........................................
2楼2011-09-01 08:33:24
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dingniu2

木虫 (正式写手)
同问
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健康最重要
3楼2011-09-01 09:07:01
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chemstar

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
4楼2011-10-12 00:53:52
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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)
怎么没有高手回答呢？ 我也很想知道啊！
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5楼2012-04-20 09:19:46
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-04-20 10:02:32
A,B,C,D分别优化得到稳定构型，然后设计反应路径，进行过渡态计算；如果是dmol的话，计算得到过渡态后，需要进行过渡态确认

[ Last edited by uuv2010 on 2012-4-20 at 10:03 ]
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

cshcgy
6楼2012-04-20 10:01:45
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cshcgy

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
1605656楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-20 10:01:45:
A,B,C,D分别优化得到稳定构型，然后设计反应路径，进行过渡态计算；如果是dmol的话，计算得到过渡态后，需要进行过渡态确认

用Dmol如果 虚频多于2个怎么办？怎么消去虚频？多谢指点~
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7楼2012-04-20 13:20:11
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
如果虚频过多，可以利用搜索到的过渡态作为初态或者末态继续寻找过渡态
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8楼2012-04-20 15:00:00
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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1605656楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-20 10:01:45:
A,B,C,D分别优化得到稳定构型，然后设计反应路径，进行过渡态计算；如果是dmol的话，计算得到过渡态后，需要进行过渡态确认

是不是要把反应物A和B放在一起呢？这样的话它们之间的距离怎么确定，该离多远才行。不知大哥遇到这样的情况没？
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9楼2012-04-20 22:43:38
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zhedaorhuali

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by wangyoucheng at 2012-04-20 22:43:38
是不是要把反应物A和B放在一起呢？这样的话它们之间的距离怎么确定，该离多远才行。不知大哥遇到这样的情况没？...

您好，请问这个问题解决了嘛
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人生而自由，却无往而不在枷锁之中
10楼2014-07-30 15:46:20
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