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cshcgy

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[求助] 两个反应物生成两个产物如何进行过渡态搜索

请问用MS里的Dmol3搜索过渡态
例如A+B=C+D这种反应，如何进行过渡态搜索
是将A、B、C、D分别优化，然后 A、B放在一起优化，C、D放在一起优化，确保虚频，然后匹配原子，TSsearch吗？
请高手指教！！多谢了

[ Last edited by cshcgy on 2011-7-20 at 20:13 ]

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1楼2011-07-20 20:12:17

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bjdyadx

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我也为此事烦恼，希望有大牛能指教.........

.........................................

2楼2011-09-01 08:33:24

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dingniu2

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同问

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3楼2011-09-01 09:07:01

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chemstar

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本帖内容被屏蔽

4楼2011-10-12 00:53:52

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wangyoucheng

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怎么没有高手回答呢？我也很想知道啊！

5楼2012-04-20 09:19:46

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uuv2010

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★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-04-20 10:02:32

A,B,C,D分别优化得到稳定构型，然后设计反应路径，进行过渡态计算；如果是dmol的话，计算得到过渡态后，需要进行过渡态确认

[ Last edited by uuv2010 on 2012-4-20 at 10:03 ]

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6楼2012-04-20 10:01:45

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cshcgy

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引用回帖:

1605656楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-20 10:01:45:
A,B,C,D分别优化得到稳定构型，然后设计反应路径，进行过渡态计算；如果是dmol的话，计算得到过渡态后，需要进行过渡态确认

用Dmol如果虚频多于2个怎么办？怎么消去虚频？多谢指点~

7楼2012-04-20 13:20:11

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uuv2010

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如果虚频过多，可以利用搜索到的过渡态作为初态或者末态继续寻找过渡态

8楼2012-04-20 15:00:00

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引用回帖:

1605656楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-20 10:01:45:
A,B,C,D分别优化得到稳定构型，然后设计反应路径，进行过渡态计算；如果是dmol的话，计算得到过渡态后，需要进行过渡态确认

是不是要把反应物A和B放在一起呢？这样的话它们之间的距离怎么确定，该离多远才行。不知大哥遇到这样的情况没？

9楼2012-04-20 22:43:38

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引用回帖:

9楼: Originally posted by wangyoucheng at 2012-04-20 22:43:38
是不是要把反应物A和B放在一起呢？这样的话它们之间的距离怎么确定，该离多远才行。不知大哥遇到这样的情况没？...

您好，请问这个问题解决了嘛

人生而自由，却无往而不在枷锁之中

10楼2014-07-30 15:46:20

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