| 查看: 3491 | 回复: 10 | ||||
[交流]
模拟键的断裂是不是不需要做过渡态的计算？
|
||||
|
本人在算单键断裂形成两个自由基的反应能垒的计算，本来是想像算化学反应一样算过渡态与原料的能量差来得到，但是看到有人这样说： “对于没有过渡态的反应，一是从化学背景上可以判断是没有过渡态的，二是计算中确实找不到，若满足这两个条件，则可以肯定其是没有过渡态了。这时就不用作 IRC 了！用 SCAN 直接对断裂的键（比如稳定分子分解为两个自由基的反应）进行扫描。”那在键断裂的过程中是不是压根就没有过渡态的存在？而我在实际计算中用TS计算（把键拉长20%）是可以得到一个虚频的过渡态，还请大家给指条路。 [ Last edited by invincibly on 2011-5-18 at 16:40 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Gaussian |
» 猜你喜欢
全奖博士 英国利物浦大学 × 台湾清华大学 联合培养
已经有0人回复
-
寻博导
已经有13人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有145人回复
-
基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书
已经有9人回复
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
已经有16人回复
-
一志愿南大理论与计算化学方向（070300）342分，求调剂
已经有1人回复
-
欢迎化学、化工、物理、材料、或计算机背景的考研咨询
已经有0人回复
-
哈尔滨工业大学（深圳）绿色化学团队招收2026年秋季入学博士生
已经有11人回复
-
澳大利亚昆士兰科技大学PhD博士奖学金
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 高斯过渡态的寻找
已经有4人回复
- 有关键能计算的几个问题
已经有9人回复
- 求助——如何用Chem3D/ChemBio3D计算过渡态的能量？
已经有15人回复
- 关于自由基反应过渡态问题。
已经有7人回复
- Dmol3 键没有断裂
已经有15人回复
- 化学反应中的形成能（formation energy）应该怎样计算
已经有6人回复
- 计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么
已经有8人回复
- 怎么得到反应物的能量
已经有8人回复
- 求一个过渡态算例
已经有9人回复
- 过渡态、预解离态与化学键断裂顺序如何？
已经有4人回复
- 高斯计算过渡态时的能垒总是负值
已经有13人回复
- 两个反应物 生成两个产物 如何进行过渡态搜索
已经有10人回复
- 拉伸断裂 化学键
已经有11人回复
- 关于过渡态与过渡结构
已经有3人回复
- 【求助】自由基的能量计算
已经有13人回复
- 【讨论】关于Gaussian ]计算反应能垒
已经有13人回复
- 【求助】请教CASTEP过渡态搜索和频率计算如何弄？
已经有3人回复
- 【求助】化学反应的能垒问题
已经有6人回复
- 【求助】irc曲线问题
已经有3人回复
- 【求助】为什么用IRC分析到不了产物？
已经有11人回复
- 【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论
已经有49人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
物理学 调剂
+1/84
-
本安ia MFC用于危险石化环境下的乙炔脱除工艺的精准取样-艾里卡特 (Alicat)
+2/68
-
招硕士调剂生
+2/36
-
关于碳量子点抗菌的研究
+1/35
-
南开大学罗景山教授课题组招聘博士后（光/电催化、钙钛矿光伏方向）
+2/34
-
【沈阳农业大学机械专硕调剂】
+2/30
-
纺织科学与工程、材料化工方向招收研究生
+1/30
-
医学327分专硕调剂
+1/16
-
【实战型】【生物医药】2026青岛大学招博士生 含少数民族骨干计划2名！！！
+1/14
-
山东省植物基蛋白技术创新中心课题组联合培养硕士研究生招募启事
+1/13
-
江苏大学环境学院课题组长期接收学硕专硕
+1/12
-
博士后招聘（高薪40万+）
+1/8
-
教育部长江学者和创新团队发展计划”入选团队招收 材料，化学与化工博士研究生
+1/8
-
聊城大学化院青椒招收化学相关专业调剂学生
+1/7
-
重庆大学药学院闫海龙课题组拟招收2026年申请考核制博士研究生
+1/5
-
上海第二工业大学-朱大海课题组招生（过线就能调剂）
+1/5
-
上海师范大学化学与材料科学学院任新意副研究员招收调剂学生3-4名（有机化学专业）
+1/5
-
首次招收资格，招收工科调剂！
+1/4
-
高校招聘
+1/3
-
澳大利亚科学院院士Prof.Gordon Wallace, University of Wollongong 全奖博士机会
+1/1
2楼2011-05-18 16:44:16
★ ★
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-18 21:38:47
invincibly(金币+15): 谢谢你的回复，这对我的帮助很大，我觉得也应该做一下IRC。我也是才做过渡态，很多事情不清楚，希望有经验的虫子们能解答你的疑惑。总之非常感谢你！ 2011-05-18 22:03:05
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-18 21:38:47
invincibly(金币+15): 谢谢你的回复，这对我的帮助很大，我觉得也应该做一下IRC。我也是才做过渡态，很多事情不清楚，希望有经验的虫子们能解答你的疑惑。总之非常感谢你！ 2011-05-18 22:03:05
|
个人认为这个过程简单来看无非是3种情况。 第一，无过渡态且体系的能量在键的断裂过程中是不断下降的。一般要这个键非常不稳定才可能出现这种情况。不过我猜楼主想模拟的键应该不是这种情况。 第二，无过渡态且体系能量在键的断裂过程中是不断上升的，直到生成的两个自由基被分离到无穷远。一般这就是键能ＢＤＥ的计算，用断裂之后形成的两个独立的自由基分子碎片的能量减去反应物的能量。 第三，有过渡态存在，体系能量随着键的断裂先升后降低。楼主既然找到了一个过渡态，那么可以看看虚频的震动模式是否正确，如果正确可以做个IRC分析看看是否此过渡态真的连接你的反应物和产物。 在做iRC分析的时候我有点疑惑，对于IRC分析所找到的过渡态之后的类产物分子可能需要指定自旋多重度为3才对。至于势能面扫描为什么没有过渡态我就不太清楚了，是否势能曲线属于直升或直降，没有一点幅度？还是说扫描的间距太宽，漏过了过渡态？ 我属菜鸟，如果有错误欢迎高手指明，以免误人子弟 |
3楼2011-05-18 20:26:53
4楼2011-05-23 09:58:38
5楼2011-05-23 10:05:23
7楼2011-07-02 00:16:25
★
invincibly(金币+1):谢谢参与
invincibly(金币+1):谢谢参与
|
到底在找TS前，要不要分别优化反应物和产物的结构呢？ 坛子里的GaussianFAQ实践版（V27.01）中(http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146&fpage=0&view=&highlight=&page=1)，强调必须优化(该汇总精华贴中第二章第19小节)。 另外，楼主使用的方法(把类似产物的结构要断裂的那个键手工拉长)是不是拉的还不够长，才导致优化后又还原而不是预期的得到两个独立的自由基呢？ |
8楼2011-07-02 20:02:24
★ ★ ★ ★
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-02 21:02:16
invincibly(金币+5): 谢谢你的贡献，以后再搞这个的时候好好学习一下 2011-07-03 18:33:56
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-02 21:02:16
invincibly(金币+5): 谢谢你的贡献，以后再搞这个的时候好好学习一下 2011-07-03 18:33:56
|
这个问题，我以前也有过疑问。 根据热力学定律，肯定是存在化学键时物质更稳定。所以，有化学键存在时，肯定不是能量特别高的状态（相对于键断裂时）。 不过确实也见过模拟化学键断裂过程中过渡态的情形，印象中的专著有类似物理有机化学之类的，是英文专著。 一般可能比较难模拟把。 松散过渡态的概念，你可以搜索一下，也许对你有帮助。 |
9楼2011-07-02 20:39:20
10楼2011-12-01 20:44:40
11楼2016-07-05 18:27:34
简单回复
huagai6楼
2011-07-01 16:55
回复
invincibly(金币+1):谢谢参与
