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小罗008

木虫 (小有名气)

[求助] 有关键能计算的几个问题 已有1人参与

问问大家，如何求的化合物的键能，我之前做的时候主要会计算总化合物的能量，用opt freq，之后计算各个自由基的能连，也是opt freq，但是计算结束后，我发现出来的分子结构和输入的不一样，单双键也发生变化，是否需要opt=(modredundant) freq,很是不明白，望大家帮帮忙，指教一下
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1楼 2014-04-07 16:20:51
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小罗008

木虫 (小有名气)
怎么没人回复，希望大家积极发言，、、
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2楼2014-04-08 08:47:53
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小罗008: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2014-04-08 13:10:51
你先要理解为什么要做opt+freq。
然后你再考虑把其分成若干个自由基的情况下是否要这么做。
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3楼2014-04-08 11:50:56
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小罗008

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-08 11:50:56
你先要理解为什么要做opt+freq。
然后你再考虑把其分成若干个自由基的情况下是否要这么做。

其实我的理解不知道对不对，一般对于未优化过的结构计算能量没有意义，所以需要opt，freq获得的Sum of electronic and thermal Enthalpies即为所要自由基的能量，本人不是专门学化学计算的对于量子计算只明白步骤，但是具体原理不是很理解，至于我要获得这个化合物某处的键能是不是opt freq 后获得Sum of electronic and thermal Enthalpies加减计算就行了？不明白的地方还望高手多多帮助。。。
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4楼2014-04-08 13:18:35
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小罗008 at 2014-04-08 13:18:35
其实我的理解不知道对不对，一般对于未优化过的结构计算能量没有意义，所以需要opt，freq获得的Sum of electronic and thermal Enthalpies即为所要自由基的能量，本人不是专门学化学计算的对于量子计算只明白步骤， ...

opt是把一个结构优化到驻点，freq是检查此时的结构是不是驻点，在驻点成立的情况下freq的热力学数据才是有用的。
如果你是把一个分子拆成一个个自由基后分别对这些自由基进行opt的话，根据opt的原理，你想想结果可能会怎么样？
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5楼2014-04-08 13:27:36
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小罗008

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-08 13:27:36
opt是把一个结构优化到驻点，freq是检查此时的结构是不是驻点，在驻点成立的情况下freq的热力学数据才是有用的。
如果你是把一个分子拆成一个个自由基后分别对这些自由基进行opt的话，根据opt的原理，你想想结果可 ...

如果我没理解错的话，你的意思是说我这样做是对的，优化出来的结构和初始结构不一样是正常的，只要自由基最后收敛就行了，对吧？可能我问的问题在你看来很菜，但是对于我来说很有用，期待你的回答。。。。
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6楼2014-04-08 14:43:41
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小罗008 at 2014-04-08 14:43:41
如果我没理解错的话，你的意思是说我这样做是对的，优化出来的结构和初始结构不一样是正常的，只要自由基最后收敛就行了，对吧？可能我问的问题在你看来很菜，但是对于我来说很有用，期待你的回答。。。。...

opt是这个意思，但是自由基的结构如果变了，不同结构得出的能量还能加减么？
另外我纠正一下，freq的热力学的数据不一定非要是驻点才能算。
你可以试试不加opt来算自由基
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7楼2014-04-08 15:04:11
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小罗008

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-08 15:04:11
opt是这个意思，但是自由基的结构如果变了，不同结构得出的能量还能加减么？
另外我纠正一下，freq的热力学的数据不一定非要是驻点才能算。
你可以试试不加opt来算自由基...

好的，你的意思是在计算自由基的时不需要再经行优化了，对吧，之前我也想这么做，但是我在小木虫上见过求键能的相关帖子，上面是opt freq后获得Sum of electronic and thermal Enthalpies，进行计算的，谢谢的回答
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8楼2014-04-08 15:31:43
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 小罗008 at 2014-04-08 15:31:43
好的，你的意思是在计算自由基的时不需要再经行优化了，对吧，之前我也想这么做，但是我在小木虫上见过求键能的相关帖子，上面是opt freq后获得Sum of electronic and thermal Enthalpies，进行计算的，谢谢的回答...

我的理解是这样的，如果是你说的那样的话可能是用了opt=modredundant，似乎这个更好一点，之前没想到。。。
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小罗008
9楼2014-04-08 19:49:06
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小罗008

木虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-08 19:49:06
我的理解是这样的，如果是你说的那样的话可能是用了opt=modredundant，似乎这个更好一点，之前没想到。。。...

好的，真心的的非常感谢你，那我试试opt=modredundant freq 试试，不管怎么样，很感激你的积极回复
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10楼2014-04-09 08:46:30
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