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有关键能计算的几个问题
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小罗008
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有关键能计算的几个问题
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问问大家,如何求的化合物的键能,我之前做的时候主要会计算总化合物的能量,用opt freq,之后计算各个自由基的能连,也是opt freq,但是计算结束后,我发现出来的分子结构和输入的不一样,单双键也发生变化,是否需要opt=(modredundant) freq,很是不明白,望大家帮帮忙,指教一下
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2014-04-07 16:20:51
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怎么没人回复,希望大家积极发言,、、
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2014-04-08 08:47:53
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2014-04-08 13:10:51
你先要理解为什么要做opt+freq。
然后你再考虑把其分成若干个自由基的情况下是否要这么做。
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3楼
2014-04-08 11:50:56
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枪下游魂
at 2014-04-08 11:50:56
你先要理解为什么要做opt+freq。
然后你再考虑把其分成若干个自由基的情况下是否要这么做。
其实我的理解不知道对不对,一般对于未优化过的结构计算能量没有意义,所以需要opt,freq获得的Sum of electronic and thermal Enthalpies即为所要自由基的能量,本人不是专门学化学计算的对于量子计算只明白步骤,但是具体原理不是很理解,至于我要获得这个化合物某处的键能是不是opt freq 后获得Sum of electronic and thermal Enthalpies加减计算就行了?不明白的地方还望高手多多帮助。。。
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2014-04-08 13:18:35
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小罗008
at 2014-04-08 13:18:35
其实我的理解不知道对不对,一般对于未优化过的结构计算能量没有意义,所以需要opt,freq获得的Sum of electronic and thermal Enthalpies即为所要自由基的能量,本人不是专门学化学计算的对于量子计算只明白步骤, ...
opt是把一个结构优化到驻点,freq是检查此时的结构是不是驻点,在驻点成立的情况下freq的热力学数据才是有用的。
如果你是把一个分子拆成一个个自由基后分别对这些自由基进行opt的话,根据opt的原理,你想想结果可能会怎么样?
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2014-04-08 13:27:36
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at 2014-04-08 13:27:36
opt是把一个结构优化到驻点,freq是检查此时的结构是不是驻点,在驻点成立的情况下freq的热力学数据才是有用的。
如果你是把一个分子拆成一个个自由基后分别对这些自由基进行opt的话,根据opt的原理,你想想结果可 ...
如果我没理解错的话,你的意思是说我这样做是对的,优化出来的结构和初始结构不一样是正常的,只要自由基最后收敛就行了,对吧?可能我问的问题在你看来很菜,但是对于我来说很有用,期待你的回答。。。。
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2014-04-08 14:43:41
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如果我没理解错的话,你的意思是说我这样做是对的,优化出来的结构和初始结构不一样是正常的,只要自由基最后收敛就行了,对吧?可能我问的问题在你看来很菜,但是对于我来说很有用,期待你的回答。。。。...
opt是这个意思,但是自由基的结构如果变了,不同结构得出的能量还能加减么?
另外我纠正一下,freq的热力学的数据不一定非要是驻点才能算。
你可以试试不加opt来算自由基
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2014-04-08 15:04:11
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枪下游魂
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opt是这个意思,但是自由基的结构如果变了,不同结构得出的能量还能加减么?
另外我纠正一下,freq的热力学的数据不一定非要是驻点才能算。
你可以试试不加opt来算自由基...
好的,你的意思是在计算自由基的时不需要再经行优化了,对吧,之前我也想这么做,但是我在小木虫上见过求键能的相关帖子,上面是opt freq后获得Sum of electronic and thermal Enthalpies,进行计算的,谢谢的回答
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2014-04-08 15:31:43
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小罗008
at 2014-04-08 15:31:43
好的,你的意思是在计算自由基的时不需要再经行优化了,对吧,之前我也想这么做,但是我在小木虫上见过求键能的相关帖子,上面是opt freq后获得Sum of electronic and thermal Enthalpies,进行计算的,谢谢的回答...
我的理解是这样的,如果是你说的那样的话可能是用了opt=modredundant,似乎这个更好一点,之前没想到。。。
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小罗008
9楼
2014-04-08 19:49:06
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枪下游魂
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我的理解是这样的,如果是你说的那样的话可能是用了opt=modredundant,似乎这个更好一点,之前没想到。。。...
好的,真心的的非常感谢你,那我试试opt=modredundant freq 试试,不管怎么样,很感激你的积极回复
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10楼
2014-04-09 08:46:30
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