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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Dmol3 键没有断裂
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

[求助] Dmol3 键没有断裂

我用MS的Dmol3模块处理纤维素的热解，给了400K的温度，按理说纤维素的键会断裂，可是没有太多的变化，只是各个键角发生了变化，能告诉我这是怎么回事么
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1楼 2012-08-21 20:20:20
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
huangshuang1: 金币+1, ★有帮助 2012-08-22 08:52:09
xueht987: 金币+1, 鼓励交流！ 2012-08-22 14:22:13
多大的体系，MD多长时间
只是角度变的话，还有可能是温度不够
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2楼2012-08-21 22:25:33
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
我采用纤维丝的聚合度只有2，按理说体系是很小很小的，用了50步，温度应该是够的，实际条件中130度够了
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3楼2012-08-22 08:51:54
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★
huangshuang1: 金币+1 2012-08-22 18:33:01
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-08-22 21:10:08
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangshuang1 at 2012-08-22 08:51:54
我采用纤维丝的聚合度只有2，按理说体系是很小很小的，用了50步，温度应该是够的，实际条件中130度够了

只有2个聚合度应该本身这个模型就不对，我还没有见到过有哪个聚合物可以只用2个重复单元就表示聚合物的
另外，这个模拟时间确实太短了，你可以查看一下有关DFT－MD的文献，没有只模拟50步就拿到想要的结果的
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4楼2012-08-22 16:51:29
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-22 16:51:29
只有2个聚合度应该本身这个模型就不对，我还没有见到过有哪个聚合物可以只用2个重复单元就表示聚合物的
另外，这个模拟时间确实太短了，你可以查看一下有关DFT－MD的文献，没有只模拟50步就拿到想要的结果的...

我现在主要是计算机的运算能力不够，所以就只采用了2的聚合度
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5楼2012-08-22 18:34:05
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-08-22 21:10:16
引用回帖:
5楼: Originally posted by huangshuang1 at 2012-08-22 18:34:05
我现在主要是计算机的运算能力不够，所以就只采用了2的聚合度...

但是做计算应该首先考虑的是模型或方法合理不合理，模拟本身就是不合理的，那么算出来了又有什么意义呢
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huangshuang1
6楼2012-08-22 20:38:05
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
恩 谢谢你 我现在聚合度变成10  步数500步 但估计我这计算得算上一个星期了
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7楼2012-08-23 11:00:23
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-22 20:38:05
但是做计算应该首先考虑的是模型或方法合理不合理，模拟本身就是不合理的，那么算出来了又有什么意义呢...

你好啊，我现在用了2个星期时间，1000K的温度（足够高了），200步，怎么还是没有出现断键的情况啊，还只是键长、键角变化，你能帮我分析分析么
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8楼2012-09-09 15:10:46
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
huangshuang1: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-09-10 10:41:09
huangshuang1: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-09-11 11:00:26
引用回帖:
8楼: Originally posted by huangshuang1 at 2012-09-09 15:10:46
你好啊，我现在用了2个星期时间，1000K的温度（足够高了），200步，怎么还是没有出现断键的情况啊，还只是键长、键角变化，你能帮我分析分析么...

200步，默认的话，就是0.2 ps，时间有点短吧
居然跑了2个星期，你这机器够慢的
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huangshuang1
9楼2012-09-10 08:41:25
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-10 08:41:25
200步，默认的话，就是0.2 ps，时间有点短吧
居然跑了2个星期，你这机器够慢的...

我每重新设置一次，代价都挺大的。你还是觉得我的步数太少，还可能有别的问题出现么
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10楼2012-09-10 10:42:12
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