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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Dmol3 键没有断裂
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by huangshuang1 at 2012-09-10 10:42:12
我每重新设置一次，代价都挺大的。你还是觉得我的步数太少，还可能有别的问题出现么...

MD的步数小于1000，基本上结果就是不可信的。我知道的MD结果最起码要跑3000步，并且要把前500-1000步给忽略掉。
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相逢是缘！
11楼2012-09-10 16:32:11
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-10 08:41:25
200步，默认的话，就是0.2 ps，时间有点短吧
居然跑了2个星期，你这机器够慢的...

还想请问下，在使用AC模块中，为什么我的聚合物和水有些部分都在盒子外面，这些是自动生成的，并且每次生成的形状都不一样，我能自己调整放好么，怎么调，还是说用AC可以设置位置的？？
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12楼2012-09-11 11:02:07
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-10 08:41:25
200步，默认的话，就是0.2 ps，时间有点短吧
居然跑了2个星期，你这机器够慢的...

请问一下，在AC中，我的聚合物和水分子感觉在盒子外面，这个有问题么，并且每次生成的放置的位置都不一样，这能设置吗？能手动调整吗？
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13楼2012-09-11 11:04:07
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★
huangshuang1: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-09-12 08:21:28
引用回帖:
13楼: Originally posted by huangshuang1 at 2012-09-11 11:04:07
请问一下，在AC中，我的聚合物和水分子感觉在盒子外面，这个有问题么，并且每次生成的放置的位置都不一样，这能设置吗？能手动调整吗？...

没有问题，仅仅是显示方式而已
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14楼2012-09-12 00:37:45
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-12 00:37:45
没有问题，仅仅是显示方式而已...

谢谢你拉
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15楼2012-09-12 08:21:40
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yurivivi

新虫 (小有名气)
引用回帖:
15楼: Originally posted by huangshuang1 at 2012-09-12 08:21:40
谢谢你拉...

不知道楼主最后是怎么解决问题的呢？求指教。
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16楼2015-04-17 10:52:24
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