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huangshuang1

木虫 (著名写手)

[求助] Dmol3 键没有断裂

我用MS的Dmol3模块处理纤维素的热解,给了400K的温度,按理说纤维素的键会断裂,可是没有太多的变化,只是各个键角发生了变化,能告诉我这是怎么回事么
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

我采用纤维丝的聚合度只有2,按理说体系是很小很小的,用了50步,温度应该是够的,实际条件中130度够了
3楼2012-08-22 08:51:54
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-22 16:51:29
只有2个聚合度应该本身这个模型就不对,我还没有见到过有哪个聚合物可以只用2个重复单元就表示聚合物的
另外,这个模拟时间确实太短了,你可以查看一下有关DFT-MD的文献,没有只模拟50步就拿到想要的结果的...

我现在主要是计算机的运算能力不够,所以就只采用了2的聚合度
5楼2012-08-22 18:34:05
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

恩 谢谢你 我现在聚合度变成10  步数500步 但估计我这计算得算上一个星期了
7楼2012-08-23 11:00:23
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-22 20:38:05
但是做计算应该首先考虑的是模型或方法合理不合理,模拟本身就是不合理的,那么算出来了又有什么意义呢...

你好啊,我现在用了2个星期时间,1000K的温度(足够高了),200步,怎么还是没有出现断键的情况啊,还只是键长、键角变化,你能帮我分析分析么
8楼2012-09-09 15:10:46
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-10 08:41:25
200步,默认的话,就是0.2 ps,时间有点短吧
居然跑了2个星期,你这机器够慢的...

我每重新设置一次,代价都挺大的。你还是觉得我的步数太少,还可能有别的问题出现么
10楼2012-09-10 10:42:12
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-10 08:41:25
200步,默认的话,就是0.2 ps,时间有点短吧
居然跑了2个星期,你这机器够慢的...

还想请问下,在使用AC模块中,为什么我的聚合物和水有些部分都在盒子外面,这些是自动生成的,并且每次生成的形状都不一样,我能自己调整放好么,怎么调,还是说用AC可以设置位置的??
12楼2012-09-11 11:02:07
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-10 08:41:25
200步,默认的话,就是0.2 ps,时间有点短吧
居然跑了2个星期,你这机器够慢的...

请问一下,在AC中,我的聚合物和水分子感觉在盒子外面,这个有问题么,并且每次生成的放置的位置都不一样,这能设置吗?能手动调整吗?
13楼2012-09-11 11:04:07
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-09-12 00:37:45
没有问题,仅仅是显示方式而已...

谢谢你拉
15楼2012-09-12 08:21:40
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