| 查看: 3568 | 回复: 10 | ||||
[交流]
模拟键的断裂是不是不需要做过渡态的计算？
|
||||
|
本人在算单键断裂形成两个自由基的反应能垒的计算，本来是想像算化学反应一样算过渡态与原料的能量差来得到，但是看到有人这样说： “对于没有过渡态的反应，一是从化学背景上可以判断是没有过渡态的，二是计算中确实找不到，若满足这两个条件，则可以肯定其是没有过渡态了。这时就不用作 IRC 了！用 SCAN 直接对断裂的键（比如稳定分子分解为两个自由基的反应）进行扫描。”那在键断裂的过程中是不是压根就没有过渡态的存在？而我在实际计算中用TS计算（把键拉长20%）是可以得到一个虚频的过渡态，还请大家给指条路。 [ Last edited by invincibly on 2011-5-18 at 16:40 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Gaussian |
» 猜你喜欢
能源环境新材料研究团队 导师介绍 研究生招生
已经有0人回复
-
能源环境新材料研究团队 导师介绍 研究生招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有231人回复
-
348 求调剂
已经有6人回复
-
招收 材料、新能源、冶金、化工、环境 等工科类考生
已经有2人回复
-
招收 新能源、冶金、材料、化工、环境 等工科类考生
已经有0人回复
-
393求调剂推荐
已经有1人回复
-
能源环境新材料研究团队 招收 新能源、冶金、材料、化工、环境 等工科类考生
已经有0人回复
-
能源环境新材料研究团队 招收 新能源、冶金、材料、化工、环境 等工科类研究生
已经有0人回复
-
武汉纺织大学教育部重点实验室调剂
已经有0人回复
-
能源环境新材料研究团队 研究生调剂招生
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 高斯过渡态的寻找
已经有4人回复
- 有关键能计算的几个问题
已经有9人回复
- 求助——如何用Chem3D/ChemBio3D计算过渡态的能量？
已经有15人回复
- 关于自由基反应过渡态问题。
已经有7人回复
- Dmol3 键没有断裂
已经有15人回复
- 化学反应中的形成能（formation energy）应该怎样计算
已经有6人回复
- 计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么
已经有8人回复
- 怎么得到反应物的能量
已经有8人回复
- 求一个过渡态算例
已经有9人回复
- 过渡态、预解离态与化学键断裂顺序如何？
已经有4人回复
- 高斯计算过渡态时的能垒总是负值
已经有13人回复
- 两个反应物 生成两个产物 如何进行过渡态搜索
已经有10人回复
- 拉伸断裂 化学键
已经有11人回复
- 关于过渡态与过渡结构
已经有3人回复
- 【求助】自由基的能量计算
已经有13人回复
- 【讨论】关于Gaussian ]计算反应能垒
已经有13人回复
- 【求助】请教CASTEP过渡态搜索和频率计算如何弄？
已经有3人回复
- 【求助】化学反应的能垒问题
已经有6人回复
- 【求助】irc曲线问题
已经有3人回复
- 【求助】为什么用IRC分析到不了产物？
已经有11人回复
- 【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论
已经有49人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
南方科技大学新材料重大科技设施研究院 科研助理招聘启事
+5/990
-
中国科学院青岛生物能源与过程研究所 招生2-3名联培生
+1/179
-
南方医科大学中药学院 调剂硕士生一名 中药学专业
+1/81
-
一志愿 中国科学技术大学生物学 365分 求调剂
+1/81
-
武汉工程大学材料学院课题组硕士调剂招生
+1/39
-
中原食品实验室 & 郑州轻工业大学2026年硕士研究生联合培养调剂公告
+1/37
-
环境化学、地学、环境毒理方向，擅长污染物迁移转化降解、分析检测、计算模拟者优先
+1/32
-
艾里卡特 (Alicat) - 燃料电池测试系统与质量流量和压力仪表
+3/28
-
澳大利亚昆士兰大学化工学院招收全奖博士生2名
+1/22
-
海南大学海洋科学学院王慧团队硕士、博士、博士后及科研骨干招聘启事
+1/12
-
求调剂
+1/10
-
湖北师范大学招调剂啦
+1/8
-
哈工大赫晓东院士团队隋超教授招收材料学博士1名
+1/5
-
广东医科大学 李雪萌教授团队 招收申请考核制博士（临床检验诊断）
+1/5
-
山东济南省属重点高校，生态环境类硕士招生 调剂 信息
+1/4
-
齐齐哈尔大学李莉课题组诚招2026级考研调剂生（学硕和专硕）
+1/4
-
调剂来这
+1/3
-
0854工学-电子信息考研-302分求调剂，接受跨专业，只求有学上！！！ ! ! ! ！
+1/2
-
5科大招收材料专业硕士
+1/1
-
湖南农业大学 环境科学与工程0830+资源与环境专硕0857 调剂名额
+1/1
2楼2011-05-18 16:44:16
★ ★
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-18 21:38:47
invincibly(金币+15): 谢谢你的回复，这对我的帮助很大，我觉得也应该做一下IRC。我也是才做过渡态，很多事情不清楚，希望有经验的虫子们能解答你的疑惑。总之非常感谢你！ 2011-05-18 22:03:05
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-18 21:38:47
invincibly(金币+15): 谢谢你的回复，这对我的帮助很大，我觉得也应该做一下IRC。我也是才做过渡态，很多事情不清楚，希望有经验的虫子们能解答你的疑惑。总之非常感谢你！ 2011-05-18 22:03:05
|
个人认为这个过程简单来看无非是3种情况。 第一，无过渡态且体系的能量在键的断裂过程中是不断下降的。一般要这个键非常不稳定才可能出现这种情况。不过我猜楼主想模拟的键应该不是这种情况。 第二，无过渡态且体系能量在键的断裂过程中是不断上升的，直到生成的两个自由基被分离到无穷远。一般这就是键能ＢＤＥ的计算，用断裂之后形成的两个独立的自由基分子碎片的能量减去反应物的能量。 第三，有过渡态存在，体系能量随着键的断裂先升后降低。楼主既然找到了一个过渡态，那么可以看看虚频的震动模式是否正确，如果正确可以做个IRC分析看看是否此过渡态真的连接你的反应物和产物。 在做iRC分析的时候我有点疑惑，对于IRC分析所找到的过渡态之后的类产物分子可能需要指定自旋多重度为3才对。至于势能面扫描为什么没有过渡态我就不太清楚了，是否势能曲线属于直升或直降，没有一点幅度？还是说扫描的间距太宽，漏过了过渡态？ 我属菜鸟，如果有错误欢迎高手指明，以免误人子弟 |
3楼2011-05-18 20:26:53
4楼2011-05-23 09:58:38
5楼2011-05-23 10:05:23
7楼2011-07-02 00:16:25
★
invincibly(金币+1):谢谢参与
invincibly(金币+1):谢谢参与
|
到底在找TS前，要不要分别优化反应物和产物的结构呢？ 坛子里的GaussianFAQ实践版（V27.01）中(http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146&fpage=0&view=&highlight=&page=1)，强调必须优化(该汇总精华贴中第二章第19小节)。 另外，楼主使用的方法(把类似产物的结构要断裂的那个键手工拉长)是不是拉的还不够长，才导致优化后又还原而不是预期的得到两个独立的自由基呢？ |
8楼2011-07-02 20:02:24
★ ★ ★ ★
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-02 21:02:16
invincibly(金币+5): 谢谢你的贡献，以后再搞这个的时候好好学习一下 2011-07-03 18:33:56
invincibly(金币+1):谢谢参与
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-02 21:02:16
invincibly(金币+5): 谢谢你的贡献，以后再搞这个的时候好好学习一下 2011-07-03 18:33:56
|
这个问题，我以前也有过疑问。 根据热力学定律，肯定是存在化学键时物质更稳定。所以，有化学键存在时，肯定不是能量特别高的状态（相对于键断裂时）。 不过确实也见过模拟化学键断裂过程中过渡态的情形，印象中的专著有类似物理有机化学之类的，是英文专著。 一般可能比较难模拟把。 松散过渡态的概念，你可以搜索一下，也许对你有帮助。 |
9楼2011-07-02 20:39:20
10楼2011-12-01 20:44:40
11楼2016-07-05 18:27:34
简单回复
huagai6楼
2011-07-01 16:55
回复
invincibly(金币+1):谢谢参与
