| 查看: 4476 | 回复: 13 | ||||
[交流]
【讨论】关于Gaussian ]计算反应能垒
|
||||
|
用Gaussian 计算反应路径能垒的时候,要分别给出反应路径上的稳定点(反应起始物,中间体和产物)和过渡态在势能面上的能量值.能垒就是"山峰"和"山谷"之间的能量差值. 例如:对于A+B--->C+D的反应, 我想问的就是在画势能面图的时候,零点的选择应该是怎么样的? 1.按照单独A,单独B的优化结构的能量加和值. 2.由第一个过渡态IRC计算得到的点,再优化结构得到A+B的能量值. 上面两种计算方法,得到的结果是不一样的,第一种方法得到的能量起始点的能量要高于第二点的能量.因为A+B的结构中,A和B之间有相互作用力(范德华力,静电力或者有氢键作用),正是这种相互作用力的存在使得体系能量值偏低. 如果两个分子仅仅是弱的相互作用,比如说范德华力,那么差别不是很大,1~2kcal/mol,那么这两种计算方法得到的过渡态的能垒的差别应该差不多. 但是,如果两个分子之间有多个氢键作用,或者有很强的静电力,那么这个差值就非常明显了(10kcal/mol)以上.请问如果是这种情况,应该怎么办?是不是就只能是采用A+B的值作为能量的起点? 如果在有氢键作用的情况下,用A+B作为能量计算的起点,那么也就是说在结构A+B中就已经含有分子间氢键,在第一个过渡态TS1中也含有分子间氢键,能垒计算为TS1-(A+B)的值,就体现不出来由于氢键作用而使得反应能垒降低了. 而反应过程中的确是因为氢键的作用而促进了化学反应的进行. 请教一下大家这样的问题是怎么处理的? 谢谢帮助! [ Last edited by majun04 on 2011-1-17 at 09:44 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 量化 |
» 猜你喜欢
福建理工大学资源化学专业正式获批并启动招生
已经有32人回复
-
Crystals（IF=2.9）- Special Issue invatation- Functional Materials
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有175人回复
-
分子筛催化方向 一篇cej共一第一 可以申请上海什么学校呢
已经有4人回复
-
求助共晶分子筛的电镜图分析，有偿
已经有1人回复
-
中南大学化学化工学院招收电池储能、理论计算方向博士生
已经有16人回复
-
请问哪里可以代烧带压力的炉子？
已经有6人回复
-
关于合成MIL-125的求助
已经有0人回复
-
双非本硕光催化方向想读博，请各位老师看看我！
已经有2人回复
-
瑞典林雪平大学范立洲课题组现招聘博士后、岗位制博士生
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请问 gaussian 怎么看 一个反应是否是自由基反应。
已经有7人回复
- 求gaussian计算反应速率常数，指前因子方法。
已经有25人回复
- 高斯计算过渡态时的能垒总是负值
已经有13人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 模拟键的断裂是不是不需要做过渡态的计算？
已经有10人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有106人回复
- 【求助】高斯计算结果中的能量问题
已经有5人回复
- 【求助】想用gaussian计算乙二胺在硅晶体表面上的吸附反应怎么计算
已经有8人回复
- 【讨论】Gaussian03研究化学反应机理（如催化酯水解）
已经有8人回复
- 【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论
已经有49人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
西湖大学物理学、光学、电子信息方向博士生招生（长期有效）
+5/160
-
山东第一医科大学医工交叉团队2025年招收纳米医学、药物化学等领域副教授、博士后
+1/76
-
Postdoctoral fellow in Medicinal Chemistry, McGill University
+1/72
-
没基金，自费做nature课题值得吗?
+1/44
-
西湖大学物理学、光学、电子信息方向博士生招生（长期有效）
+5/40
-
中国特种设备检测研究院招聘1名高温涂层方向博士后
+2/40
-
大连理工大学化学学院界面介导黏附与组装课题组招收推免生
+1/31
-
大连理工大学化学学院界面介导黏附与组装课题组招收2027级推免生/考研生
+1/31
-
深圳大学 招收2027级推免研究生 (金属材料/ 3D打印/ 氢能等方向)
+1/26
-
诚征女友( 西安 )
+1/25
-
西湖大学拓扑光学、非厄米光学、太赫兹方向博士后招聘（长期有效）
+5/25
-
国家自然科学基金申报者发榜前心理状态调查，麻烦帮忙填一下哇！
+1/22
-
浙江大学王宇课题组诚聘博士后/博士研究生/科研助理（招聘长期有效）
+1/11
-
浙江大学医学院附属妇产科医院张霈婧课题组招科研助理——生物信息方向
+2/10
-
多本Scopus收录国际英文期刊征稿，全免 APC！含医学期刊
+1/8
-
国际 EI 会议征稿进行时
+1/5
-
大家有research gate的账号吗？有偿借用
+1/4
-
有没有管理类博士招生
+1/4
-
破五唯不包括专利是吧？
+1/3
-
中山大学招收2027级硕士研究生（增材制造/机器学习）
+1/1
2楼2011-01-17 11:10:35
3楼2011-01-17 11:14:35
4楼2011-01-17 11:32:35
5楼2011-01-17 17:53:46
8楼2011-01-18 12:21:34
9楼2011-01-18 17:47:34
10楼2011-07-26 16:13:05
11楼2011-07-26 21:35:19
12楼2012-02-28 10:31:45
13楼2012-02-28 13:59:19
14楼2013-04-16 09:16:32
简单回复
zyxme6楼
2011-01-17 18:30
回复
majun04(金币+1):谢谢参与
wwjm05717楼
2011-01-18 11:02
回复
majun04(金币+1):谢谢参与