| 查看: 3959 | 回复: 13 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
【讨论】关于Gaussian ]计算反应能垒
|
||||
|
用Gaussian 计算反应路径能垒的时候,要分别给出反应路径上的稳定点(反应起始物,中间体和产物)和过渡态在势能面上的能量值.能垒就是"山峰"和"山谷"之间的能量差值. 例如:对于A+B--->C+D的反应, 我想问的就是在画势能面图的时候,零点的选择应该是怎么样的? 1.按照单独A,单独B的优化结构的能量加和值. 2.由第一个过渡态IRC计算得到的点,再优化结构得到A+B的能量值. 上面两种计算方法,得到的结果是不一样的,第一种方法得到的能量起始点的能量要高于第二点的能量.因为A+B的结构中,A和B之间有相互作用力(范德华力,静电力或者有氢键作用),正是这种相互作用力的存在使得体系能量值偏低. 如果两个分子仅仅是弱的相互作用,比如说范德华力,那么差别不是很大,1~2kcal/mol,那么这两种计算方法得到的过渡态的能垒的差别应该差不多. 但是,如果两个分子之间有多个氢键作用,或者有很强的静电力,那么这个差值就非常明显了(10kcal/mol)以上.请问如果是这种情况,应该怎么办?是不是就只能是采用A+B的值作为能量的起点? 如果在有氢键作用的情况下,用A+B作为能量计算的起点,那么也就是说在结构A+B中就已经含有分子间氢键,在第一个过渡态TS1中也含有分子间氢键,能垒计算为TS1-(A+B)的值,就体现不出来由于氢键作用而使得反应能垒降低了. 而反应过程中的确是因为氢键的作用而促进了化学反应的进行. 请教一下大家这样的问题是怎么处理的? 谢谢帮助! [ Last edited by majun04 on 2011-1-17 at 09:44 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 量化 |
» 猜你喜欢
书籍求助：汽车市场营销理论与实务（电子版）——章小平
已经有0人回复
-
东方理-中科大联合博士生招聘
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有82人回复
-
钴酸锂半电池小倍率容量上不去
已经有1人回复
-
吉林大学材料物理本科生求问调剂信息
已经有23人回复
-
2026第二届光电子与半导体器件前沿技术研讨会——光电子赋能·半导体创芯！
已经有1人回复
-
光电子赋能·半导体创芯！
已经有1人回复
-
光电子赋能·半导体创芯！
已经有0人回复
-
QE计算电声耦合的时候报错Error in routine lambda (100)wrong or too many modes
已经有2人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请问 gaussian 怎么看 一个反应是否是自由基反应。
已经有7人回复
- 求gaussian计算反应速率常数，指前因子方法。
已经有25人回复
- 高斯计算过渡态时的能垒总是负值
已经有13人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 模拟键的断裂是不是不需要做过渡态的计算？
已经有10人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有105人回复
- 【求助】高斯计算结果中的能量问题
已经有5人回复
- 【求助】想用gaussian计算乙二胺在硅晶体表面上的吸附反应怎么计算
已经有8人回复
- 【讨论】Gaussian03研究化学反应机理（如催化酯水解）
已经有8人回复
- 【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论
已经有49人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
西湖大学2026年秋季入学物理学、光学、电子信息方向博士生有名额速来！！！
+2/260
-
华南师范大学（211）- 光电科学与工程学院 - 申请审核制（2026年4-5月份面试考核）
+2/106
-
石河子大学化学化工学院CJ学者领衔分子炼油团队招收博士、硕士。【接收调剂】
+1/88
-
广州大学“长江学者”教授团队2026年海内外高层次人才招聘（环境/化学/生物）
+1/77
-
欢迎报考南京农业大学植物环境适应课题组课题组2026级博士生。
+1/75
-
山东征女友，坐标济南
+1/69
-
上海交通大学大气环境科学课题组招收2026年入学博士生
+1/67
-
有没有人做过这种结构的顺式体向反式体的转化？
+1/34
-
同济大学脑机智能团队脑机接口方向招生招聘
+1/30
-
中科院深圳先进技术研究院招聘免疫及计算生物学方向博士后、科研助理或联培学生
+1/10
-
国内树枝状聚合物现在进入量产了吗？
+1/10
-
中国科学技术大学环境系招生
+1/9
-
都放假了嘛？
+1/7
-
【东南大学博士后、科研助理招聘】
+1/5
-
香港中文大学（深圳）陈筱萌 课题组招生公告（博士 / 博后 / 硕士 / RA）
+1/4
-
澳科大招收2026年秋季药剂学/生物材料方向全奖博士研究生（春节不打烊）
+1/4
-
澳科大药学院诚招2026年秋季药剂学/生物材料硕士研究生（2026年3月5日报名截止）
+1/4
-
【科研助理招聘-北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队】
+1/3
-
队友
+1/3
-
化学行业，研发出创新的东西是做成项目给公司吃提成，还是自己搞小作坊倒卖？
+1/1
8楼2011-01-18 12:21:34
2楼2011-01-17 11:10:35
3楼2011-01-17 11:14:35
4楼2011-01-17 11:32:35