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04nylxb

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教CASTEP过渡态搜索和频率计算如何弄?

请教各位高手,用CASTEP计算表面反应过程,如CO+H2在Cu(111)面上合成甲醇过程,文献一般都是先优化计算得到各种adsorbate intermediates在表面的吸附构型,然后第二部分是各个基元反应的计算,搜索过渡态,得到活化能。第一步:吸附质在表面的吸附构型优化,这一步很好理解就是各个如CO H2 CH3OH HCOH HCHOH HCH2OH 在表面的吸附,tp fcc hcp br。
现在遇到困难的是第二步,基元反应,过渡态搜索。比如,基元反应, HCOH+H=HCHOH,反应物是HCOH和吸附的H,产物是HCHOH,那在Reaction Preview里面,product是否是选择上一步优化好的吸附中间物HCHOH?那反应物呢?上一步优化好的只有HCOH,没有吸附的H原子,是否是在上一步优化好的HCOH的临位的Cu原子上,手动添加一个H原子,再优化一下,才作为一个preview里面的reactant?
而且有另外一个问题,比如product里面,选择的是fcc位的HCHOH,那reactant里面是否也要选fcc位的HCOH?求高手指点。
另外一个问题是,如何计算过渡态的虚频?我找了半天,都没在properties里面找到频率计算这一项,请教,该如何操作,才能对过渡态进行频率计算呢?
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04nylxb

木虫 (正式写手)

哈哈,看来这个问题还挺多人遇到的,谢谢几位斑竹。
期待高人指点迷津……
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2楼2010-10-17 11:35:21
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04nylxb

木虫 (正式写手)

都没人回答啊……
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3楼2010-10-18 13:16:09
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王小一

金虫 (小有名气)

04nylxb(金币+3):收到,非常感谢 2010-10-18 23:18:52
引用回帖:
Originally posted by 04nylxb at 2010-10-16 11:47:36:
请教各位高手,用CASTEP计算表面反应过程,如CO+H2在Cu(111)面上合成甲醇过程,文献一般都是先优化计算得到各种adsorbate intermediates在表面的吸附构型,然后第二部分是各个基元反应的计算,搜索过渡态,得到 ...

1.H原子的引入
  “在上一步优化好的HCOH的临位的Cu原子上,手动添加一个H原子,再优化一下,才作为一个preview里面的reactant”----正确
   但是这个距离要得当,这个需要自己尝试,首先不能影响你HCOH的构型,另外还不能距离你的反应活性中心太远。
2.最好还是fcc,不过也不一定,但吸附构型的翻转式需要不少能量的
3.IR spectrum可以得到频率,这个计算起来很耗时间,建议你要优化好构型再进行频率计算
4楼2010-10-18 14:28:40
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